Protein–RNA interactions for Protein: Q00975

CACNA1B, Voltage-dependent N-type calcium channel subunit alpha-1B, humanhuman

Predictions only

Length 2,339 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNA1BQ00975 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CACNA1BQ00975 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
CACNA1BQ00975 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CACNA1BQ00975 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
CACNA1BQ00975 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CACNA1BQ00975 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CACNA1BQ00975 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CACNA1BQ00975 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CACNA1BQ00975 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CACNA1BQ00975 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CACNA1BQ00975 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CACNA1BQ00975 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CACNA1BQ00975 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
CACNA1BQ00975 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CACNA1BQ00975 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CACNA1BQ00975 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CACNA1BQ00975 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CACNA1BQ00975 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CACNA1BQ00975 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CACNA1BQ00975 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
CACNA1BQ00975 AC027682.4-201ENST00000605277 798 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CACNA1BQ00975 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CACNA1BQ00975 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CACNA1BQ00975 PLPP7-201ENST00000372261 972 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CACNA1BQ00975 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
CACNA1BQ00975 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CACNA1BQ00975 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CACNA1BQ00975 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CACNA1BQ00975 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CACNA1BQ00975 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CACNA1BQ00975 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CACNA1BQ00975 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CACNA1BQ00975 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CACNA1BQ00975 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CACNA1BQ00975 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CACNA1BQ00975 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
CACNA1BQ00975 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CACNA1BQ00975 CAPN10-203ENST00000352879 862 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CACNA1BQ00975 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CACNA1BQ00975 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CACNA1BQ00975 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CACNA1BQ00975 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CACNA1BQ00975 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CACNA1BQ00975 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
CACNA1BQ00975 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CACNA1BQ00975 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
CACNA1BQ00975 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CACNA1BQ00975 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CACNA1BQ00975 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CACNA1BQ00975 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CACNA1BQ00975 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CACNA1BQ00975 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CACNA1BQ00975 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CACNA1BQ00975 ECEL1P3-201ENST00000427961 737 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
CACNA1BQ00975 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CACNA1BQ00975 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
CACNA1BQ00975 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CACNA1BQ00975 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CACNA1BQ00975 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CACNA1BQ00975 GSTM4-201ENST00000326729 1321 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CACNA1BQ00975 SELENOS-203ENST00000526049 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CACNA1BQ00975 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CACNA1BQ00975 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CACNA1BQ00975 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CACNA1BQ00975 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CACNA1BQ00975 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CACNA1BQ00975 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CACNA1BQ00975 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
CACNA1BQ00975 ZNF337-AS1-204ENST00000428254 817 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CACNA1BQ00975 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CACNA1BQ00975 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CACNA1BQ00975 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CACNA1BQ00975 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CACNA1BQ00975 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CACNA1BQ00975 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CACNA1BQ00975 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CACNA1BQ00975 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
CACNA1BQ00975 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
CACNA1BQ00975 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CACNA1BQ00975 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CACNA1BQ00975 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CACNA1BQ00975 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CACNA1BQ00975 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CACNA1BQ00975 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CACNA1BQ00975 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
CACNA1BQ00975 TMUB1-205ENST00000482202 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CACNA1BQ00975 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CACNA1BQ00975 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CACNA1BQ00975 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CACNA1BQ00975 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CACNA1BQ00975 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CACNA1BQ00975 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CACNA1BQ00975 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CACNA1BQ00975 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CACNA1BQ00975 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CACNA1BQ00975 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CACNA1BQ00975 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CACNA1BQ00975 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CACNA1BQ00975 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CACNA1BQ00975 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.2 ms