Protein–RNA interactions for Protein: Q00535

CDK5, Cyclin-dependent-like kinase 5, humanhuman

Predictions only

Length 292 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK5Q00535 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
CDK5Q00535 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC20.69■□□□□ 0.9
CDK5Q00535 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
CDK5Q00535 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
CDK5Q00535 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
CDK5Q00535 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
CDK5Q00535 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
CDK5Q00535 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
CDK5Q00535 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
CDK5Q00535 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
CDK5Q00535 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
CDK5Q00535 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
CDK5Q00535 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
CDK5Q00535 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC20.67■□□□□ 0.9
CDK5Q00535 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
CDK5Q00535 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
CDK5Q00535 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
CDK5Q00535 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC20.67■□□□□ 0.9
CDK5Q00535 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
CDK5Q00535 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC20.67■□□□□ 0.9
CDK5Q00535 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC20.67■□□□□ 0.9
CDK5Q00535 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
CDK5Q00535 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
CDK5Q00535 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.67■□□□□ 0.9
CDK5Q00535 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
CDK5Q00535 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
CDK5Q00535 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
CDK5Q00535 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
CDK5Q00535 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
CDK5Q00535 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC20.66■□□□□ 0.9
CDK5Q00535 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
CDK5Q00535 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC20.66■□□□□ 0.9
CDK5Q00535 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
CDK5Q00535 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
CDK5Q00535 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
CDK5Q00535 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
CDK5Q00535 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
CDK5Q00535 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
CDK5Q00535 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
CDK5Q00535 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
CDK5Q00535 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC20.65■□□□□ 0.9
CDK5Q00535 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
CDK5Q00535 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
CDK5Q00535 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
CDK5Q00535 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
CDK5Q00535 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
CDK5Q00535 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
CDK5Q00535 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.9
CDK5Q00535 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
CDK5Q00535 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.9
CDK5Q00535 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
CDK5Q00535 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
CDK5Q00535 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
CDK5Q00535 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
CDK5Q00535 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
CDK5Q00535 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
CDK5Q00535 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
CDK5Q00535 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
CDK5Q00535 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
CDK5Q00535 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
CDK5Q00535 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
CDK5Q00535 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
CDK5Q00535 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
CDK5Q00535 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
CDK5Q00535 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
CDK5Q00535 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
CDK5Q00535 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
CDK5Q00535 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
CDK5Q00535 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
CDK5Q00535 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
CDK5Q00535 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
CDK5Q00535 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
CDK5Q00535 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
CDK5Q00535 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
CDK5Q00535 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
CDK5Q00535 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
CDK5Q00535 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
CDK5Q00535 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
CDK5Q00535 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
CDK5Q00535 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
CDK5Q00535 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
CDK5Q00535 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
CDK5Q00535 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
CDK5Q00535 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CDK5Q00535 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CDK5Q00535 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CDK5Q00535 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
CDK5Q00535 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
CDK5Q00535 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
CDK5Q00535 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CDK5Q00535 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CDK5Q00535 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
CDK5Q00535 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CDK5Q00535 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CDK5Q00535 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CDK5Q00535 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
CDK5Q00535 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CDK5Q00535 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
CDK5Q00535 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC20.61■□□□□ 0.89
CDK5Q00535 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.8 ms