Protein–RNA interactions for Protein: P98155

VLDLR, Very low-density lipoprotein receptor, humanhuman

Predictions only

Length 873 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VLDLRP98155 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
VLDLRP98155 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
VLDLRP98155 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
VLDLRP98155 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
VLDLRP98155 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
VLDLRP98155 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
VLDLRP98155 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
VLDLRP98155 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
VLDLRP98155 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
VLDLRP98155 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
VLDLRP98155 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
VLDLRP98155 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
VLDLRP98155 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
VLDLRP98155 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
VLDLRP98155 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
VLDLRP98155 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
VLDLRP98155 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
VLDLRP98155 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
VLDLRP98155 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
VLDLRP98155 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
VLDLRP98155 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
VLDLRP98155 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
VLDLRP98155 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
VLDLRP98155 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
VLDLRP98155 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
VLDLRP98155 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
VLDLRP98155 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
VLDLRP98155 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
VLDLRP98155 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC21.29■■□□□ 1
VLDLRP98155 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
VLDLRP98155 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
VLDLRP98155 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
VLDLRP98155 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
VLDLRP98155 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
VLDLRP98155 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
VLDLRP98155 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
VLDLRP98155 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
VLDLRP98155 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
VLDLRP98155 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
VLDLRP98155 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
VLDLRP98155 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
VLDLRP98155 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
VLDLRP98155 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
VLDLRP98155 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
VLDLRP98155 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
VLDLRP98155 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
VLDLRP98155 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
VLDLRP98155 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
VLDLRP98155 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
VLDLRP98155 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
VLDLRP98155 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC21.27■■□□□ 1
VLDLRP98155 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
VLDLRP98155 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■■□□□ 1
VLDLRP98155 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
VLDLRP98155 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
VLDLRP98155 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
VLDLRP98155 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
VLDLRP98155 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
VLDLRP98155 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
VLDLRP98155 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
VLDLRP98155 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
VLDLRP98155 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
VLDLRP98155 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
VLDLRP98155 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
VLDLRP98155 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
VLDLRP98155 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
VLDLRP98155 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
VLDLRP98155 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
VLDLRP98155 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
VLDLRP98155 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
VLDLRP98155 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
VLDLRP98155 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
VLDLRP98155 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
VLDLRP98155 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
VLDLRP98155 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
VLDLRP98155 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
VLDLRP98155 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
VLDLRP98155 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
VLDLRP98155 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
VLDLRP98155 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
VLDLRP98155 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
VLDLRP98155 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
VLDLRP98155 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
VLDLRP98155 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
VLDLRP98155 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
VLDLRP98155 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
VLDLRP98155 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC21.23■□□□□ 0.99
VLDLRP98155 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
VLDLRP98155 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
VLDLRP98155 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
VLDLRP98155 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
VLDLRP98155 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC21.23■□□□□ 0.99
VLDLRP98155 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
VLDLRP98155 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
VLDLRP98155 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
VLDLRP98155 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
VLDLRP98155 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
VLDLRP98155 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
VLDLRP98155 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
VLDLRP98155 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33 ms