Protein–RNA interactions for Protein: P84550

SKOR1, SKI family transcriptional corepressor 1, humanhuman

Predictions only

Length 965 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SKOR1P84550 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SKOR1P84550 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SKOR1P84550 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
SKOR1P84550 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SKOR1P84550 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
SKOR1P84550 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC23.9■■□□□ 1.42
SKOR1P84550 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
SKOR1P84550 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
SKOR1P84550 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SKOR1P84550 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SKOR1P84550 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
SKOR1P84550 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
SKOR1P84550 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
SKOR1P84550 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
SKOR1P84550 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
SKOR1P84550 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
SKOR1P84550 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SKOR1P84550 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SKOR1P84550 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SKOR1P84550 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SKOR1P84550 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SKOR1P84550 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
SKOR1P84550 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SKOR1P84550 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SKOR1P84550 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SKOR1P84550 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
SKOR1P84550 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SKOR1P84550 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
SKOR1P84550 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
SKOR1P84550 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SKOR1P84550 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SKOR1P84550 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SKOR1P84550 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SKOR1P84550 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
SKOR1P84550 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
SKOR1P84550 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SKOR1P84550 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
SKOR1P84550 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
SKOR1P84550 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
SKOR1P84550 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
SKOR1P84550 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
SKOR1P84550 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SKOR1P84550 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
SKOR1P84550 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
SKOR1P84550 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
SKOR1P84550 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
SKOR1P84550 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
SKOR1P84550 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC23.85■■□□□ 1.41
SKOR1P84550 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
SKOR1P84550 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
SKOR1P84550 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
SKOR1P84550 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
SKOR1P84550 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
SKOR1P84550 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
SKOR1P84550 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
SKOR1P84550 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SKOR1P84550 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SKOR1P84550 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
SKOR1P84550 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
SKOR1P84550 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
SKOR1P84550 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
SKOR1P84550 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SKOR1P84550 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SKOR1P84550 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
SKOR1P84550 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
SKOR1P84550 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
SKOR1P84550 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
SKOR1P84550 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
SKOR1P84550 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC23.83■■□□□ 1.41
SKOR1P84550 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
SKOR1P84550 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
SKOR1P84550 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
SKOR1P84550 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC23.83■■□□□ 1.4
SKOR1P84550 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
SKOR1P84550 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
SKOR1P84550 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
SKOR1P84550 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
SKOR1P84550 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC23.82■■□□□ 1.4
SKOR1P84550 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
SKOR1P84550 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC23.82■■□□□ 1.4
SKOR1P84550 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
SKOR1P84550 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
SKOR1P84550 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
SKOR1P84550 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
SKOR1P84550 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
SKOR1P84550 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
SKOR1P84550 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
SKOR1P84550 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
SKOR1P84550 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
SKOR1P84550 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
SKOR1P84550 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
SKOR1P84550 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
SKOR1P84550 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
SKOR1P84550 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
SKOR1P84550 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC23.81■■□□□ 1.4
SKOR1P84550 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
SKOR1P84550 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
SKOR1P84550 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
SKOR1P84550 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
SKOR1P84550 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.1 ms