Protein–RNA interactions for Protein: P84022

SMAD3, Mothers against decapentaplegic homolog 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 425 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMAD3P84022 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
SMAD3P84022 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
SMAD3P84022 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
SMAD3P84022 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
SMAD3P84022 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
SMAD3P84022 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
SMAD3P84022 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
SMAD3P84022 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
SMAD3P84022 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
SMAD3P84022 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
SMAD3P84022 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
SMAD3P84022 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
SMAD3P84022 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
SMAD3P84022 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
SMAD3P84022 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
SMAD3P84022 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC24.96■■□□□ 1.59
SMAD3P84022 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
SMAD3P84022 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
SMAD3P84022 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.59
SMAD3P84022 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
SMAD3P84022 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
SMAD3P84022 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
SMAD3P84022 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.58
SMAD3P84022 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
SMAD3P84022 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
SMAD3P84022 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.95■■□□□ 1.58
SMAD3P84022 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
SMAD3P84022 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
SMAD3P84022 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
SMAD3P84022 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
SMAD3P84022 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
SMAD3P84022 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
SMAD3P84022 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
SMAD3P84022 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
SMAD3P84022 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
SMAD3P84022 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
SMAD3P84022 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
SMAD3P84022 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
SMAD3P84022 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
SMAD3P84022 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
SMAD3P84022 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
SMAD3P84022 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
SMAD3P84022 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC24.93■■□□□ 1.58
SMAD3P84022 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
SMAD3P84022 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
SMAD3P84022 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
SMAD3P84022 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
SMAD3P84022 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
SMAD3P84022 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
SMAD3P84022 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
SMAD3P84022 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
SMAD3P84022 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
SMAD3P84022 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
SMAD3P84022 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
SMAD3P84022 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
SMAD3P84022 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
SMAD3P84022 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
SMAD3P84022 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
SMAD3P84022 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
SMAD3P84022 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
SMAD3P84022 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
SMAD3P84022 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC24.91■■□□□ 1.58
SMAD3P84022 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
SMAD3P84022 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
SMAD3P84022 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
SMAD3P84022 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
SMAD3P84022 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
SMAD3P84022 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
SMAD3P84022 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
SMAD3P84022 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC24.9■■□□□ 1.58
SMAD3P84022 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
SMAD3P84022 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
SMAD3P84022 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
SMAD3P84022 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
SMAD3P84022 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
SMAD3P84022 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
SMAD3P84022 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
SMAD3P84022 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
SMAD3P84022 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
SMAD3P84022 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
SMAD3P84022 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
SMAD3P84022 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
SMAD3P84022 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
SMAD3P84022 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
SMAD3P84022 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
SMAD3P84022 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
SMAD3P84022 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC24.89■■□□□ 1.57
SMAD3P84022 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
SMAD3P84022 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
SMAD3P84022 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC24.88■■□□□ 1.57
SMAD3P84022 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
SMAD3P84022 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
SMAD3P84022 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC24.88■■□□□ 1.57
SMAD3P84022 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
SMAD3P84022 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
SMAD3P84022 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
SMAD3P84022 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
SMAD3P84022 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
SMAD3P84022 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
SMAD3P84022 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.7 ms