Protein–RNA interactions for Protein: P78556

CCL20, C-C motif chemokine 20, humanhuman

Predictions only

Length 96 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCL20P78556 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CCL20P78556 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CCL20P78556 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CCL20P78556 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CCL20P78556 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CCL20P78556 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CCL20P78556 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CCL20P78556 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CCL20P78556 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CCL20P78556 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CCL20P78556 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CCL20P78556 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CCL20P78556 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CCL20P78556 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CCL20P78556 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CCL20P78556 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CCL20P78556 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CCL20P78556 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CCL20P78556 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CCL20P78556 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CCL20P78556 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CCL20P78556 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CCL20P78556 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CCL20P78556 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CCL20P78556 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CCL20P78556 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
CCL20P78556 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CCL20P78556 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CCL20P78556 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CCL20P78556 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CCL20P78556 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CCL20P78556 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CCL20P78556 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CCL20P78556 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CCL20P78556 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CCL20P78556 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
CCL20P78556 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
CCL20P78556 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
CCL20P78556 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
CCL20P78556 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CCL20P78556 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CCL20P78556 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CCL20P78556 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CCL20P78556 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CCL20P78556 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CCL20P78556 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CCL20P78556 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CCL20P78556 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CCL20P78556 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CCL20P78556 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
CCL20P78556 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CCL20P78556 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
CCL20P78556 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CCL20P78556 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
CCL20P78556 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC18■□□□□ 0.47
CCL20P78556 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
CCL20P78556 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CCL20P78556 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CCL20P78556 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CCL20P78556 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CCL20P78556 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CCL20P78556 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CCL20P78556 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CCL20P78556 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CCL20P78556 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CCL20P78556 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CCL20P78556 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CCL20P78556 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CCL20P78556 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CCL20P78556 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CCL20P78556 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CCL20P78556 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CCL20P78556 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CCL20P78556 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CCL20P78556 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CCL20P78556 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CCL20P78556 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CCL20P78556 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CCL20P78556 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CCL20P78556 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CCL20P78556 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CCL20P78556 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CCL20P78556 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CCL20P78556 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CCL20P78556 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CCL20P78556 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CCL20P78556 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CCL20P78556 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CCL20P78556 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CCL20P78556 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CCL20P78556 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CCL20P78556 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CCL20P78556 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CCL20P78556 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CCL20P78556 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CCL20P78556 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CCL20P78556 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CCL20P78556 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CCL20P78556 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CCL20P78556 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.2 ms