Protein–RNA interactions for Protein: P78412

IRX6, Iroquois-class homeodomain protein IRX-6, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 446 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IRX6P78412 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
IRX6P78412 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC29.78■■■□□ 2.36
IRX6P78412 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
IRX6P78412 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
IRX6P78412 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.78■■■□□ 2.36
IRX6P78412 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
IRX6P78412 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC29.78■■■□□ 2.36
IRX6P78412 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC29.78■■■□□ 2.36
IRX6P78412 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
IRX6P78412 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
IRX6P78412 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
IRX6P78412 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
IRX6P78412 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC29.78■■■□□ 2.36
IRX6P78412 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC29.78■■■□□ 2.36
IRX6P78412 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
IRX6P78412 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
IRX6P78412 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
IRX6P78412 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
IRX6P78412 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
IRX6P78412 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
IRX6P78412 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
IRX6P78412 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
IRX6P78412 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
IRX6P78412 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC29.77■■■□□ 2.36
IRX6P78412 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
IRX6P78412 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.77■■■□□ 2.36
IRX6P78412 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
IRX6P78412 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
IRX6P78412 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.77■■■□□ 2.36
IRX6P78412 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.77■■■□□ 2.36
IRX6P78412 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC29.76■■■□□ 2.36
IRX6P78412 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.36
IRX6P78412 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.36
IRX6P78412 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.76■■■□□ 2.35
IRX6P78412 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
IRX6P78412 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC29.76■■■□□ 2.35
IRX6P78412 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC29.76■■■□□ 2.35
IRX6P78412 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC29.76■■■□□ 2.35
IRX6P78412 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
IRX6P78412 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.76■■■□□ 2.35
IRX6P78412 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.75■■■□□ 2.35
IRX6P78412 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
IRX6P78412 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
IRX6P78412 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC29.75■■■□□ 2.35
IRX6P78412 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
IRX6P78412 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
IRX6P78412 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC29.75■■■□□ 2.35
IRX6P78412 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
IRX6P78412 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
IRX6P78412 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
IRX6P78412 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC29.74■■■□□ 2.35
IRX6P78412 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC29.74■■■□□ 2.35
IRX6P78412 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC29.74■■■□□ 2.35
IRX6P78412 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC29.74■■■□□ 2.35
IRX6P78412 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC29.74■■■□□ 2.35
IRX6P78412 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
IRX6P78412 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
IRX6P78412 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.74■■■□□ 2.35
IRX6P78412 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
IRX6P78412 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.73■■■□□ 2.35
IRX6P78412 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.73■■■□□ 2.35
IRX6P78412 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
IRX6P78412 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
IRX6P78412 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
IRX6P78412 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
IRX6P78412 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC29.72■■■□□ 2.35
IRX6P78412 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC29.72■■■□□ 2.35
IRX6P78412 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
IRX6P78412 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC29.72■■■□□ 2.35
IRX6P78412 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC29.72■■■□□ 2.35
IRX6P78412 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC29.72■■■□□ 2.35
IRX6P78412 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.72■■■□□ 2.35
IRX6P78412 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
IRX6P78412 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
IRX6P78412 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.72■■■□□ 2.35
IRX6P78412 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
IRX6P78412 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
IRX6P78412 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
IRX6P78412 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
IRX6P78412 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
IRX6P78412 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC29.71■■■□□ 2.35
IRX6P78412 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC29.71■■■□□ 2.35
IRX6P78412 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC29.71■■■□□ 2.35
IRX6P78412 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC29.71■■■□□ 2.35
IRX6P78412 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.71■■■□□ 2.35
IRX6P78412 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC29.71■■■□□ 2.35
IRX6P78412 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
IRX6P78412 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
IRX6P78412 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC29.71■■■□□ 2.35
IRX6P78412 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
IRX6P78412 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.34
IRX6P78412 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
IRX6P78412 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC29.69■■■□□ 2.34
IRX6P78412 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC29.69■■■□□ 2.34
IRX6P78412 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
IRX6P78412 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
IRX6P78412 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC29.69■■■□□ 2.34
IRX6P78412 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC29.69■■■□□ 2.34
IRX6P78412 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
IRX6P78412 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65.2 ms