Protein–RNA interactions for Protein: P68104

EEF1A1, Elongation factor 1-alpha 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 462 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EEF1A1P68104 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
EEF1A1P68104 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
EEF1A1P68104 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
EEF1A1P68104 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
EEF1A1P68104 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
EEF1A1P68104 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
EEF1A1P68104 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
EEF1A1P68104 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
EEF1A1P68104 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
EEF1A1P68104 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
EEF1A1P68104 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
EEF1A1P68104 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
EEF1A1P68104 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
EEF1A1P68104 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
EEF1A1P68104 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
EEF1A1P68104 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
EEF1A1P68104 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
EEF1A1P68104 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
EEF1A1P68104 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
EEF1A1P68104 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
EEF1A1P68104 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
EEF1A1P68104 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
EEF1A1P68104 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
EEF1A1P68104 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
EEF1A1P68104 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
EEF1A1P68104 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
EEF1A1P68104 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
EEF1A1P68104 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
EEF1A1P68104 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
EEF1A1P68104 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
EEF1A1P68104 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
EEF1A1P68104 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
EEF1A1P68104 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
EEF1A1P68104 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
EEF1A1P68104 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
EEF1A1P68104 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
EEF1A1P68104 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
EEF1A1P68104 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
EEF1A1P68104 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
EEF1A1P68104 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
EEF1A1P68104 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
EEF1A1P68104 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
EEF1A1P68104 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
EEF1A1P68104 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
EEF1A1P68104 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
EEF1A1P68104 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
EEF1A1P68104 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
EEF1A1P68104 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
EEF1A1P68104 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
EEF1A1P68104 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
EEF1A1P68104 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
EEF1A1P68104 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
EEF1A1P68104 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
EEF1A1P68104 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
EEF1A1P68104 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
EEF1A1P68104 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
EEF1A1P68104 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
EEF1A1P68104 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
EEF1A1P68104 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
EEF1A1P68104 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
EEF1A1P68104 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
EEF1A1P68104 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
EEF1A1P68104 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
EEF1A1P68104 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
EEF1A1P68104 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC21.11■□□□□ 0.97
EEF1A1P68104 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
EEF1A1P68104 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
EEF1A1P68104 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
EEF1A1P68104 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
EEF1A1P68104 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
EEF1A1P68104 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
EEF1A1P68104 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
EEF1A1P68104 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
EEF1A1P68104 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
EEF1A1P68104 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
EEF1A1P68104 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
EEF1A1P68104 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
EEF1A1P68104 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
EEF1A1P68104 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
EEF1A1P68104 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
EEF1A1P68104 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
EEF1A1P68104 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
EEF1A1P68104 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
EEF1A1P68104 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
EEF1A1P68104 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
EEF1A1P68104 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
EEF1A1P68104 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
EEF1A1P68104 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
EEF1A1P68104 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
EEF1A1P68104 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
EEF1A1P68104 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
EEF1A1P68104 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
EEF1A1P68104 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
EEF1A1P68104 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
EEF1A1P68104 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
EEF1A1P68104 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
EEF1A1P68104 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
EEF1A1P68104 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
EEF1A1P68104 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
EEF1A1P68104 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 113.9 ms