Protein–RNA interactions for Protein: P68032

ACTC1, Actin, alpha cardiac muscle 1, humanhuman

Predictions only

Length 377 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTC1P68032 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
ACTC1P68032 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
ACTC1P68032 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
ACTC1P68032 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
ACTC1P68032 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
ACTC1P68032 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
ACTC1P68032 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
ACTC1P68032 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
ACTC1P68032 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC20.35■□□□□ 0.85
ACTC1P68032 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
ACTC1P68032 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
ACTC1P68032 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
ACTC1P68032 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
ACTC1P68032 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
ACTC1P68032 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
ACTC1P68032 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
ACTC1P68032 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
ACTC1P68032 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC20.35■□□□□ 0.85
ACTC1P68032 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
ACTC1P68032 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
ACTC1P68032 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC20.34■□□□□ 0.85
ACTC1P68032 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
ACTC1P68032 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
ACTC1P68032 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
ACTC1P68032 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
ACTC1P68032 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
ACTC1P68032 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
ACTC1P68032 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
ACTC1P68032 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
ACTC1P68032 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
ACTC1P68032 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
ACTC1P68032 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
ACTC1P68032 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
ACTC1P68032 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
ACTC1P68032 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
ACTC1P68032 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
ACTC1P68032 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
ACTC1P68032 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
ACTC1P68032 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
ACTC1P68032 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
ACTC1P68032 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
ACTC1P68032 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
ACTC1P68032 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
ACTC1P68032 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
ACTC1P68032 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
ACTC1P68032 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
ACTC1P68032 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
ACTC1P68032 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
ACTC1P68032 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
ACTC1P68032 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
ACTC1P68032 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
ACTC1P68032 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
ACTC1P68032 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
ACTC1P68032 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
ACTC1P68032 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
ACTC1P68032 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
ACTC1P68032 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
ACTC1P68032 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
ACTC1P68032 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
ACTC1P68032 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
ACTC1P68032 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
ACTC1P68032 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.31■□□□□ 0.84
ACTC1P68032 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
ACTC1P68032 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
ACTC1P68032 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
ACTC1P68032 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
ACTC1P68032 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
ACTC1P68032 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
ACTC1P68032 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
ACTC1P68032 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
ACTC1P68032 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
ACTC1P68032 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
ACTC1P68032 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
ACTC1P68032 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
ACTC1P68032 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
ACTC1P68032 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
ACTC1P68032 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
ACTC1P68032 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
ACTC1P68032 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
ACTC1P68032 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
ACTC1P68032 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
ACTC1P68032 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC20.29■□□□□ 0.84
ACTC1P68032 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
ACTC1P68032 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
ACTC1P68032 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC20.29■□□□□ 0.84
ACTC1P68032 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
ACTC1P68032 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
ACTC1P68032 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
ACTC1P68032 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
ACTC1P68032 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
ACTC1P68032 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
ACTC1P68032 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
ACTC1P68032 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
ACTC1P68032 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
ACTC1P68032 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
ACTC1P68032 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
ACTC1P68032 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
ACTC1P68032 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
ACTC1P68032 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
ACTC1P68032 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 74.2 ms