Protein–RNA interactions for Protein: P63316

TNNC1, Troponin C, slow skeletal and cardiac muscles, humanhuman

Predictions only

Length 161 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNNC1P63316 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
TNNC1P63316 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
TNNC1P63316 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
TNNC1P63316 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
TNNC1P63316 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
TNNC1P63316 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
TNNC1P63316 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
TNNC1P63316 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
TNNC1P63316 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
TNNC1P63316 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
TNNC1P63316 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
TNNC1P63316 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
TNNC1P63316 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
TNNC1P63316 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
TNNC1P63316 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
TNNC1P63316 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
TNNC1P63316 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
TNNC1P63316 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
TNNC1P63316 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
TNNC1P63316 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
TNNC1P63316 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
TNNC1P63316 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
TNNC1P63316 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
TNNC1P63316 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
TNNC1P63316 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
TNNC1P63316 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
TNNC1P63316 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
TNNC1P63316 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
TNNC1P63316 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
TNNC1P63316 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC24.81■■□□□ 1.56
TNNC1P63316 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
TNNC1P63316 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
TNNC1P63316 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
TNNC1P63316 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
TNNC1P63316 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
TNNC1P63316 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
TNNC1P63316 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
TNNC1P63316 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
TNNC1P63316 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
TNNC1P63316 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
TNNC1P63316 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
TNNC1P63316 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
TNNC1P63316 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
TNNC1P63316 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
TNNC1P63316 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
TNNC1P63316 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
TNNC1P63316 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
TNNC1P63316 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
TNNC1P63316 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
TNNC1P63316 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
TNNC1P63316 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
TNNC1P63316 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
TNNC1P63316 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
TNNC1P63316 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
TNNC1P63316 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
TNNC1P63316 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
TNNC1P63316 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
TNNC1P63316 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
TNNC1P63316 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
TNNC1P63316 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
TNNC1P63316 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
TNNC1P63316 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
TNNC1P63316 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
TNNC1P63316 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
TNNC1P63316 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
TNNC1P63316 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
TNNC1P63316 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
TNNC1P63316 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
TNNC1P63316 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
TNNC1P63316 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
TNNC1P63316 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
TNNC1P63316 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
TNNC1P63316 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
TNNC1P63316 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
TNNC1P63316 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
TNNC1P63316 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
TNNC1P63316 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
TNNC1P63316 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
TNNC1P63316 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
TNNC1P63316 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
TNNC1P63316 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
TNNC1P63316 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
TNNC1P63316 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
TNNC1P63316 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
TNNC1P63316 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
TNNC1P63316 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
TNNC1P63316 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
TNNC1P63316 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC24.75■■□□□ 1.55
TNNC1P63316 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
TNNC1P63316 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
TNNC1P63316 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
TNNC1P63316 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
TNNC1P63316 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
TNNC1P63316 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
TNNC1P63316 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
TNNC1P63316 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
TNNC1P63316 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
TNNC1P63316 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
TNNC1P63316 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
TNNC1P63316 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.7 ms