Protein–RNA interactions for Protein: P63208

SKP1, S-phase kinase-associated protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 163 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SKP1P63208 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SKP1P63208 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
SKP1P63208 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SKP1P63208 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SKP1P63208 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
SKP1P63208 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
SKP1P63208 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
SKP1P63208 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SKP1P63208 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
SKP1P63208 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SKP1P63208 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
SKP1P63208 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
SKP1P63208 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SKP1P63208 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
SKP1P63208 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
SKP1P63208 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
SKP1P63208 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
SKP1P63208 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SKP1P63208 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
SKP1P63208 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
SKP1P63208 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SKP1P63208 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.07
SKP1P63208 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SKP1P63208 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SKP1P63208 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
SKP1P63208 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
SKP1P63208 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SKP1P63208 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
SKP1P63208 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
SKP1P63208 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
SKP1P63208 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SKP1P63208 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
SKP1P63208 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
SKP1P63208 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SKP1P63208 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
SKP1P63208 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
SKP1P63208 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SKP1P63208 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SKP1P63208 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SKP1P63208 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
SKP1P63208 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SKP1P63208 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SKP1P63208 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SKP1P63208 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SKP1P63208 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
SKP1P63208 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SKP1P63208 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
SKP1P63208 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
SKP1P63208 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SKP1P63208 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
SKP1P63208 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SKP1P63208 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SKP1P63208 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
SKP1P63208 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SKP1P63208 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
SKP1P63208 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
SKP1P63208 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SKP1P63208 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
SKP1P63208 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
SKP1P63208 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
SKP1P63208 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
SKP1P63208 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
SKP1P63208 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SKP1P63208 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SKP1P63208 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SKP1P63208 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SKP1P63208 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SKP1P63208 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
SKP1P63208 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
SKP1P63208 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SKP1P63208 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SKP1P63208 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SKP1P63208 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
SKP1P63208 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
SKP1P63208 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SKP1P63208 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SKP1P63208 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SKP1P63208 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
SKP1P63208 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
SKP1P63208 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
SKP1P63208 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
SKP1P63208 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
SKP1P63208 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
SKP1P63208 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SKP1P63208 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.06
SKP1P63208 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
SKP1P63208 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC21.64■■□□□ 1.05
SKP1P63208 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
SKP1P63208 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
SKP1P63208 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
SKP1P63208 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
SKP1P63208 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
SKP1P63208 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
SKP1P63208 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SKP1P63208 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SKP1P63208 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SKP1P63208 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SKP1P63208 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SKP1P63208 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SKP1P63208 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.5 ms