Protein–RNA interactions for Protein: P62333

PSMC6, 26S proteasome regulatory subunit 10B, humanhuman

Predictions only

Length 389 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMC6P62333 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
PSMC6P62333 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
PSMC6P62333 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
PSMC6P62333 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
PSMC6P62333 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
PSMC6P62333 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
PSMC6P62333 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
PSMC6P62333 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
PSMC6P62333 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
PSMC6P62333 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
PSMC6P62333 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
PSMC6P62333 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
PSMC6P62333 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
PSMC6P62333 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
PSMC6P62333 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
PSMC6P62333 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
PSMC6P62333 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
PSMC6P62333 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
PSMC6P62333 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
PSMC6P62333 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC26■■□□□ 1.75
PSMC6P62333 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
PSMC6P62333 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
PSMC6P62333 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
PSMC6P62333 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
PSMC6P62333 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
PSMC6P62333 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
PSMC6P62333 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
PSMC6P62333 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
PSMC6P62333 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
PSMC6P62333 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
PSMC6P62333 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
PSMC6P62333 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC25.98■■□□□ 1.75
PSMC6P62333 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
PSMC6P62333 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
PSMC6P62333 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
PSMC6P62333 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
PSMC6P62333 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
PSMC6P62333 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
PSMC6P62333 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
PSMC6P62333 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.96■■□□□ 1.75
PSMC6P62333 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.75
PSMC6P62333 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
PSMC6P62333 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
PSMC6P62333 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC25.95■■□□□ 1.74
PSMC6P62333 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC25.95■■□□□ 1.74
PSMC6P62333 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
PSMC6P62333 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
PSMC6P62333 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
PSMC6P62333 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
PSMC6P62333 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
PSMC6P62333 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
PSMC6P62333 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
PSMC6P62333 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
PSMC6P62333 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
PSMC6P62333 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
PSMC6P62333 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
PSMC6P62333 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
PSMC6P62333 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
PSMC6P62333 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
PSMC6P62333 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
PSMC6P62333 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
PSMC6P62333 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
PSMC6P62333 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC25.93■■□□□ 1.74
PSMC6P62333 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
PSMC6P62333 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
PSMC6P62333 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
PSMC6P62333 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
PSMC6P62333 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
PSMC6P62333 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
PSMC6P62333 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
PSMC6P62333 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
PSMC6P62333 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
PSMC6P62333 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
PSMC6P62333 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
PSMC6P62333 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC25.92■■□□□ 1.74
PSMC6P62333 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
PSMC6P62333 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
PSMC6P62333 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
PSMC6P62333 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
PSMC6P62333 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
PSMC6P62333 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
PSMC6P62333 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
PSMC6P62333 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
PSMC6P62333 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
PSMC6P62333 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
PSMC6P62333 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
PSMC6P62333 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
PSMC6P62333 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
PSMC6P62333 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
PSMC6P62333 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
PSMC6P62333 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
PSMC6P62333 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
PSMC6P62333 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
PSMC6P62333 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
PSMC6P62333 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
PSMC6P62333 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
PSMC6P62333 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
PSMC6P62333 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
PSMC6P62333 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
PSMC6P62333 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43 ms