Protein–RNA interactions for Protein: P61758

VBP1, Prefoldin subunit 3, humanhuman

Predictions only

Length 197 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VBP1P61758 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
VBP1P61758 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
VBP1P61758 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
VBP1P61758 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
VBP1P61758 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
VBP1P61758 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
VBP1P61758 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
VBP1P61758 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
VBP1P61758 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
VBP1P61758 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
VBP1P61758 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
VBP1P61758 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
VBP1P61758 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC20.49■□□□□ 0.87
VBP1P61758 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
VBP1P61758 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
VBP1P61758 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
VBP1P61758 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
VBP1P61758 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
VBP1P61758 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
VBP1P61758 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC20.49■□□□□ 0.87
VBP1P61758 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
VBP1P61758 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
VBP1P61758 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
VBP1P61758 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
VBP1P61758 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
VBP1P61758 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
VBP1P61758 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
VBP1P61758 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC20.48■□□□□ 0.87
VBP1P61758 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
VBP1P61758 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
VBP1P61758 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
VBP1P61758 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
VBP1P61758 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
VBP1P61758 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
VBP1P61758 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
VBP1P61758 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
VBP1P61758 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
VBP1P61758 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
VBP1P61758 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
VBP1P61758 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
VBP1P61758 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
VBP1P61758 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
VBP1P61758 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
VBP1P61758 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
VBP1P61758 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
VBP1P61758 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
VBP1P61758 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
VBP1P61758 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
VBP1P61758 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
VBP1P61758 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
VBP1P61758 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
VBP1P61758 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
VBP1P61758 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
VBP1P61758 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
VBP1P61758 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.87
VBP1P61758 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
VBP1P61758 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
VBP1P61758 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
VBP1P61758 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
VBP1P61758 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
VBP1P61758 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
VBP1P61758 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
VBP1P61758 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
VBP1P61758 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
VBP1P61758 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
VBP1P61758 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
VBP1P61758 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
VBP1P61758 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
VBP1P61758 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
VBP1P61758 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
VBP1P61758 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
VBP1P61758 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
VBP1P61758 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC20.44■□□□□ 0.86
VBP1P61758 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
VBP1P61758 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
VBP1P61758 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
VBP1P61758 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
VBP1P61758 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
VBP1P61758 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
VBP1P61758 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
VBP1P61758 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
VBP1P61758 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
VBP1P61758 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
VBP1P61758 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
VBP1P61758 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC20.43■□□□□ 0.86
VBP1P61758 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
VBP1P61758 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
VBP1P61758 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
VBP1P61758 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
VBP1P61758 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
VBP1P61758 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
VBP1P61758 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
VBP1P61758 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
VBP1P61758 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
VBP1P61758 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
VBP1P61758 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
VBP1P61758 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
VBP1P61758 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
VBP1P61758 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
VBP1P61758 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18 ms