Protein–RNA interactions for Protein: P61289

PSME3, Proteasome activator complex subunit 3, humanhuman

Predictions only

Length 254 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSME3P61289 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PSME3P61289 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC21.84■■□□□ 1.09
PSME3P61289 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PSME3P61289 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
PSME3P61289 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
PSME3P61289 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
PSME3P61289 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PSME3P61289 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
PSME3P61289 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
PSME3P61289 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC21.83■■□□□ 1.09
PSME3P61289 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
PSME3P61289 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
PSME3P61289 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
PSME3P61289 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
PSME3P61289 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
PSME3P61289 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
PSME3P61289 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
PSME3P61289 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
PSME3P61289 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
PSME3P61289 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
PSME3P61289 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
PSME3P61289 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PSME3P61289 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PSME3P61289 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC21.82■■□□□ 1.08
PSME3P61289 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
PSME3P61289 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
PSME3P61289 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
PSME3P61289 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PSME3P61289 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PSME3P61289 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
PSME3P61289 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
PSME3P61289 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
PSME3P61289 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
PSME3P61289 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
PSME3P61289 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
PSME3P61289 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
PSME3P61289 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
PSME3P61289 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PSME3P61289 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
PSME3P61289 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
PSME3P61289 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
PSME3P61289 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
PSME3P61289 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
PSME3P61289 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC21.8■■□□□ 1.08
PSME3P61289 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PSME3P61289 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PSME3P61289 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PSME3P61289 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
PSME3P61289 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
PSME3P61289 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
PSME3P61289 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
PSME3P61289 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
PSME3P61289 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
PSME3P61289 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
PSME3P61289 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
PSME3P61289 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
PSME3P61289 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
PSME3P61289 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
PSME3P61289 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
PSME3P61289 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
PSME3P61289 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
PSME3P61289 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
PSME3P61289 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
PSME3P61289 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
PSME3P61289 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
PSME3P61289 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
PSME3P61289 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
PSME3P61289 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
PSME3P61289 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
PSME3P61289 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
PSME3P61289 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
PSME3P61289 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
PSME3P61289 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
PSME3P61289 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
PSME3P61289 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
PSME3P61289 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
PSME3P61289 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
PSME3P61289 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
PSME3P61289 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
PSME3P61289 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC21.77■■□□□ 1.07
PSME3P61289 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC21.77■■□□□ 1.07
PSME3P61289 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
PSME3P61289 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
PSME3P61289 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
PSME3P61289 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
PSME3P61289 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
PSME3P61289 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
PSME3P61289 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
PSME3P61289 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
PSME3P61289 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
PSME3P61289 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
PSME3P61289 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
PSME3P61289 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
PSME3P61289 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC21.76■■□□□ 1.07
PSME3P61289 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
PSME3P61289 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
PSME3P61289 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
PSME3P61289 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
PSME3P61289 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
PSME3P61289 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.7 ms