Protein–RNA interactions for Protein: P61247

RPS3A, 40S ribosomal protein S3a, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 264 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPS3AP61247 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
RPS3AP61247 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
RPS3AP61247 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
RPS3AP61247 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
RPS3AP61247 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
RPS3AP61247 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
RPS3AP61247 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
RPS3AP61247 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC21.24■□□□□ 0.99
RPS3AP61247 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
RPS3AP61247 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
RPS3AP61247 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
RPS3AP61247 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
RPS3AP61247 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
RPS3AP61247 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
RPS3AP61247 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
RPS3AP61247 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
RPS3AP61247 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
RPS3AP61247 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
RPS3AP61247 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
RPS3AP61247 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
RPS3AP61247 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
RPS3AP61247 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
RPS3AP61247 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
RPS3AP61247 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
RPS3AP61247 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
RPS3AP61247 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
RPS3AP61247 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
RPS3AP61247 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
RPS3AP61247 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
RPS3AP61247 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
RPS3AP61247 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
RPS3AP61247 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
RPS3AP61247 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
RPS3AP61247 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
RPS3AP61247 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
RPS3AP61247 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
RPS3AP61247 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
RPS3AP61247 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
RPS3AP61247 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
RPS3AP61247 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
RPS3AP61247 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
RPS3AP61247 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
RPS3AP61247 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
RPS3AP61247 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
RPS3AP61247 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
RPS3AP61247 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
RPS3AP61247 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
RPS3AP61247 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
RPS3AP61247 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
RPS3AP61247 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
RPS3AP61247 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
RPS3AP61247 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
RPS3AP61247 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.99
RPS3AP61247 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
RPS3AP61247 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
RPS3AP61247 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
RPS3AP61247 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
RPS3AP61247 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
RPS3AP61247 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
RPS3AP61247 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
RPS3AP61247 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
RPS3AP61247 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
RPS3AP61247 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
RPS3AP61247 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
RPS3AP61247 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
RPS3AP61247 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
RPS3AP61247 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
RPS3AP61247 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
RPS3AP61247 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
RPS3AP61247 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
RPS3AP61247 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
RPS3AP61247 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
RPS3AP61247 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
RPS3AP61247 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
RPS3AP61247 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
RPS3AP61247 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
RPS3AP61247 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
RPS3AP61247 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
RPS3AP61247 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
RPS3AP61247 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
RPS3AP61247 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
RPS3AP61247 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
RPS3AP61247 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
RPS3AP61247 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
RPS3AP61247 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
RPS3AP61247 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
RPS3AP61247 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
RPS3AP61247 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
RPS3AP61247 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
RPS3AP61247 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
RPS3AP61247 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
RPS3AP61247 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
RPS3AP61247 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
RPS3AP61247 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
RPS3AP61247 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
RPS3AP61247 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
RPS3AP61247 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
RPS3AP61247 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
RPS3AP61247 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
RPS3AP61247 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.7 ms