Protein–RNA interactions for Protein: P61204

ARF3, ADP-ribosylation factor 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 181 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARF3P61204 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
ARF3P61204 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
ARF3P61204 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
ARF3P61204 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
ARF3P61204 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
ARF3P61204 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
ARF3P61204 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
ARF3P61204 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
ARF3P61204 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
ARF3P61204 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
ARF3P61204 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
ARF3P61204 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
ARF3P61204 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
ARF3P61204 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
ARF3P61204 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
ARF3P61204 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
ARF3P61204 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
ARF3P61204 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
ARF3P61204 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
ARF3P61204 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
ARF3P61204 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
ARF3P61204 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
ARF3P61204 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
ARF3P61204 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
ARF3P61204 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
ARF3P61204 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
ARF3P61204 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
ARF3P61204 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
ARF3P61204 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
ARF3P61204 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
ARF3P61204 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
ARF3P61204 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
ARF3P61204 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
ARF3P61204 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
ARF3P61204 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
ARF3P61204 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
ARF3P61204 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
ARF3P61204 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
ARF3P61204 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
ARF3P61204 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
ARF3P61204 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
ARF3P61204 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
ARF3P61204 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
ARF3P61204 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
ARF3P61204 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
ARF3P61204 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
ARF3P61204 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
ARF3P61204 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
ARF3P61204 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
ARF3P61204 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
ARF3P61204 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
ARF3P61204 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
ARF3P61204 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
ARF3P61204 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
ARF3P61204 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
ARF3P61204 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
ARF3P61204 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
ARF3P61204 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
ARF3P61204 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
ARF3P61204 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
ARF3P61204 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
ARF3P61204 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
ARF3P61204 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
ARF3P61204 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
ARF3P61204 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
ARF3P61204 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
ARF3P61204 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
ARF3P61204 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
ARF3P61204 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
ARF3P61204 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
ARF3P61204 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
ARF3P61204 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
ARF3P61204 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
ARF3P61204 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
ARF3P61204 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
ARF3P61204 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
ARF3P61204 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
ARF3P61204 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
ARF3P61204 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
ARF3P61204 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
ARF3P61204 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
ARF3P61204 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
ARF3P61204 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
ARF3P61204 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
ARF3P61204 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
ARF3P61204 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
ARF3P61204 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
ARF3P61204 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
ARF3P61204 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
ARF3P61204 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
ARF3P61204 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
ARF3P61204 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC21.78■■□□□ 1.08
ARF3P61204 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
ARF3P61204 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
ARF3P61204 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
ARF3P61204 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
ARF3P61204 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
ARF3P61204 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
ARF3P61204 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
ARF3P61204 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.7 ms