Protein–RNA interactions for Protein: P57727

TMPRSS3, Transmembrane protease serine 3, humanhuman

Predictions only

Length 454 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMPRSS3P57727 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TMPRSS3P57727 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TMPRSS3P57727 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
TMPRSS3P57727 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
TMPRSS3P57727 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
TMPRSS3P57727 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC21.36■■□□□ 1.01
TMPRSS3P57727 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TMPRSS3P57727 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
TMPRSS3P57727 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC21.36■■□□□ 1.01
TMPRSS3P57727 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
TMPRSS3P57727 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
TMPRSS3P57727 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TMPRSS3P57727 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TMPRSS3P57727 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TMPRSS3P57727 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TMPRSS3P57727 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TMPRSS3P57727 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TMPRSS3P57727 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
TMPRSS3P57727 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TMPRSS3P57727 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
TMPRSS3P57727 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
TMPRSS3P57727 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
TMPRSS3P57727 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TMPRSS3P57727 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
TMPRSS3P57727 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TMPRSS3P57727 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TMPRSS3P57727 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
TMPRSS3P57727 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
TMPRSS3P57727 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TMPRSS3P57727 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TMPRSS3P57727 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
TMPRSS3P57727 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
TMPRSS3P57727 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
TMPRSS3P57727 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
TMPRSS3P57727 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
TMPRSS3P57727 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
TMPRSS3P57727 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
TMPRSS3P57727 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
TMPRSS3P57727 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.33■■□□□ 1.01
TMPRSS3P57727 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1
TMPRSS3P57727 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
TMPRSS3P57727 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
TMPRSS3P57727 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
TMPRSS3P57727 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
TMPRSS3P57727 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TMPRSS3P57727 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
TMPRSS3P57727 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
TMPRSS3P57727 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
TMPRSS3P57727 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
TMPRSS3P57727 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
TMPRSS3P57727 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TMPRSS3P57727 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
TMPRSS3P57727 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TMPRSS3P57727 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TMPRSS3P57727 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TMPRSS3P57727 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC21.31■■□□□ 1
TMPRSS3P57727 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
TMPRSS3P57727 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
TMPRSS3P57727 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TMPRSS3P57727 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
TMPRSS3P57727 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
TMPRSS3P57727 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TMPRSS3P57727 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TMPRSS3P57727 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
TMPRSS3P57727 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
TMPRSS3P57727 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TMPRSS3P57727 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TMPRSS3P57727 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TMPRSS3P57727 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
TMPRSS3P57727 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TMPRSS3P57727 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
TMPRSS3P57727 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC21.29■■□□□ 1
TMPRSS3P57727 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TMPRSS3P57727 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TMPRSS3P57727 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TMPRSS3P57727 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TMPRSS3P57727 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TMPRSS3P57727 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
TMPRSS3P57727 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
TMPRSS3P57727 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TMPRSS3P57727 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TMPRSS3P57727 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TMPRSS3P57727 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
TMPRSS3P57727 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TMPRSS3P57727 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
TMPRSS3P57727 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
TMPRSS3P57727 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
TMPRSS3P57727 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■■□□□ 1
TMPRSS3P57727 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
TMPRSS3P57727 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.27■■□□□ 1
TMPRSS3P57727 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC21.27■■□□□ 1
TMPRSS3P57727 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
TMPRSS3P57727 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
TMPRSS3P57727 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.27■□□□□ 0.99
TMPRSS3P57727 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
TMPRSS3P57727 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
TMPRSS3P57727 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
TMPRSS3P57727 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
TMPRSS3P57727 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
TMPRSS3P57727 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.9 ms