Protein–RNA interactions for Protein: P57723

PCBP4, Poly(rC)-binding protein 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 403 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCBP4P57723 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PCBP4P57723 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
PCBP4P57723 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PCBP4P57723 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PCBP4P57723 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PCBP4P57723 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PCBP4P57723 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PCBP4P57723 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
PCBP4P57723 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PCBP4P57723 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PCBP4P57723 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PCBP4P57723 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PCBP4P57723 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PCBP4P57723 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PCBP4P57723 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PCBP4P57723 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PCBP4P57723 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PCBP4P57723 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PCBP4P57723 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PCBP4P57723 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PCBP4P57723 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PCBP4P57723 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PCBP4P57723 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PCBP4P57723 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PCBP4P57723 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PCBP4P57723 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PCBP4P57723 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
PCBP4P57723 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PCBP4P57723 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PCBP4P57723 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PCBP4P57723 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PCBP4P57723 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PCBP4P57723 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PCBP4P57723 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PCBP4P57723 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PCBP4P57723 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PCBP4P57723 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PCBP4P57723 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
PCBP4P57723 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PCBP4P57723 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PCBP4P57723 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PCBP4P57723 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
PCBP4P57723 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PCBP4P57723 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PCBP4P57723 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PCBP4P57723 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PCBP4P57723 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PCBP4P57723 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
PCBP4P57723 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PCBP4P57723 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PCBP4P57723 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
PCBP4P57723 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PCBP4P57723 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PCBP4P57723 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PCBP4P57723 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PCBP4P57723 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PCBP4P57723 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
PCBP4P57723 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PCBP4P57723 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PCBP4P57723 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PCBP4P57723 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PCBP4P57723 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PCBP4P57723 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
PCBP4P57723 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PCBP4P57723 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PCBP4P57723 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PCBP4P57723 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PCBP4P57723 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PCBP4P57723 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PCBP4P57723 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PCBP4P57723 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PCBP4P57723 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PCBP4P57723 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PCBP4P57723 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PCBP4P57723 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PCBP4P57723 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PCBP4P57723 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PCBP4P57723 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PCBP4P57723 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PCBP4P57723 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PCBP4P57723 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PCBP4P57723 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PCBP4P57723 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PCBP4P57723 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PCBP4P57723 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PCBP4P57723 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PCBP4P57723 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
PCBP4P57723 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PCBP4P57723 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PCBP4P57723 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PCBP4P57723 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PCBP4P57723 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PCBP4P57723 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PCBP4P57723 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PCBP4P57723 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PCBP4P57723 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PCBP4P57723 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
PCBP4P57723 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
PCBP4P57723 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
PCBP4P57723 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.2 ms