Protein–RNA interactions for Protein: P56915

GSC, Homeobox protein goosecoid, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 257 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GSCP56915 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
GSCP56915 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
GSCP56915 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
GSCP56915 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
GSCP56915 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
GSCP56915 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
GSCP56915 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
GSCP56915 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
GSCP56915 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
GSCP56915 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
GSCP56915 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
GSCP56915 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
GSCP56915 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
GSCP56915 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
GSCP56915 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
GSCP56915 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
GSCP56915 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
GSCP56915 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
GSCP56915 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
GSCP56915 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
GSCP56915 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
GSCP56915 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
GSCP56915 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
GSCP56915 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
GSCP56915 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC24.2■■□□□ 1.46
GSCP56915 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
GSCP56915 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
GSCP56915 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
GSCP56915 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
GSCP56915 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
GSCP56915 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
GSCP56915 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
GSCP56915 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
GSCP56915 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
GSCP56915 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
GSCP56915 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
GSCP56915 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
GSCP56915 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
GSCP56915 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
GSCP56915 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
GSCP56915 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
GSCP56915 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
GSCP56915 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
GSCP56915 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
GSCP56915 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
GSCP56915 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
GSCP56915 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
GSCP56915 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
GSCP56915 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
GSCP56915 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
GSCP56915 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
GSCP56915 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
GSCP56915 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
GSCP56915 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
GSCP56915 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
GSCP56915 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
GSCP56915 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
GSCP56915 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
GSCP56915 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
GSCP56915 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
GSCP56915 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
GSCP56915 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
GSCP56915 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
GSCP56915 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
GSCP56915 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
GSCP56915 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
GSCP56915 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
GSCP56915 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
GSCP56915 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
GSCP56915 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
GSCP56915 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
GSCP56915 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
GSCP56915 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
GSCP56915 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
GSCP56915 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
GSCP56915 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
GSCP56915 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
GSCP56915 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
GSCP56915 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
GSCP56915 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
GSCP56915 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
GSCP56915 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
GSCP56915 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
GSCP56915 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
GSCP56915 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
GSCP56915 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
GSCP56915 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
GSCP56915 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
GSCP56915 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
GSCP56915 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
GSCP56915 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
GSCP56915 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
GSCP56915 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
GSCP56915 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
GSCP56915 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
GSCP56915 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
GSCP56915 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
GSCP56915 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
GSCP56915 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
GSCP56915 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.8 ms