Protein–RNA interactions for Protein: P56377

AP1S2, AP-1 complex subunit sigma-2, humanhuman

Predictions only

Length 157 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AP1S2P56377 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
AP1S2P56377 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
AP1S2P56377 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
AP1S2P56377 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
AP1S2P56377 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
AP1S2P56377 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
AP1S2P56377 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
AP1S2P56377 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
AP1S2P56377 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
AP1S2P56377 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
AP1S2P56377 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
AP1S2P56377 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
AP1S2P56377 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
AP1S2P56377 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
AP1S2P56377 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
AP1S2P56377 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
AP1S2P56377 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
AP1S2P56377 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
AP1S2P56377 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
AP1S2P56377 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
AP1S2P56377 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
AP1S2P56377 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
AP1S2P56377 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
AP1S2P56377 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
AP1S2P56377 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
AP1S2P56377 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
AP1S2P56377 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
AP1S2P56377 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC22.24■■□□□ 1.15
AP1S2P56377 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
AP1S2P56377 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
AP1S2P56377 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
AP1S2P56377 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
AP1S2P56377 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
AP1S2P56377 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
AP1S2P56377 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
AP1S2P56377 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
AP1S2P56377 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
AP1S2P56377 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
AP1S2P56377 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
AP1S2P56377 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
AP1S2P56377 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
AP1S2P56377 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
AP1S2P56377 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC22.23■■□□□ 1.15
AP1S2P56377 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
AP1S2P56377 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
AP1S2P56377 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
AP1S2P56377 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
AP1S2P56377 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
AP1S2P56377 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
AP1S2P56377 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
AP1S2P56377 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
AP1S2P56377 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
AP1S2P56377 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
AP1S2P56377 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
AP1S2P56377 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
AP1S2P56377 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
AP1S2P56377 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
AP1S2P56377 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
AP1S2P56377 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
AP1S2P56377 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
AP1S2P56377 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
AP1S2P56377 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
AP1S2P56377 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
AP1S2P56377 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
AP1S2P56377 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
AP1S2P56377 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
AP1S2P56377 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
AP1S2P56377 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
AP1S2P56377 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
AP1S2P56377 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
AP1S2P56377 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
AP1S2P56377 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
AP1S2P56377 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
AP1S2P56377 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
AP1S2P56377 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
AP1S2P56377 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
AP1S2P56377 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC22.2■■□□□ 1.14
AP1S2P56377 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
AP1S2P56377 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
AP1S2P56377 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
AP1S2P56377 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
AP1S2P56377 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
AP1S2P56377 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
AP1S2P56377 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
AP1S2P56377 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
AP1S2P56377 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
AP1S2P56377 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
AP1S2P56377 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
AP1S2P56377 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
AP1S2P56377 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
AP1S2P56377 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
AP1S2P56377 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
AP1S2P56377 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
AP1S2P56377 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
AP1S2P56377 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
AP1S2P56377 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
AP1S2P56377 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
AP1S2P56377 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
AP1S2P56377 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
AP1S2P56377 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.2 ms