Protein–RNA interactions for Protein: P55209

NAP1L1, Nucleosome assembly protein 1-like 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 391 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NAP1L1P55209 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
NAP1L1P55209 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
NAP1L1P55209 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
NAP1L1P55209 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
NAP1L1P55209 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
NAP1L1P55209 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
NAP1L1P55209 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
NAP1L1P55209 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
NAP1L1P55209 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
NAP1L1P55209 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
NAP1L1P55209 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
NAP1L1P55209 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
NAP1L1P55209 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
NAP1L1P55209 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
NAP1L1P55209 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC24.49■■□□□ 1.51
NAP1L1P55209 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
NAP1L1P55209 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
NAP1L1P55209 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
NAP1L1P55209 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
NAP1L1P55209 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
NAP1L1P55209 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
NAP1L1P55209 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
NAP1L1P55209 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
NAP1L1P55209 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
NAP1L1P55209 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
NAP1L1P55209 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
NAP1L1P55209 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
NAP1L1P55209 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
NAP1L1P55209 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
NAP1L1P55209 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
NAP1L1P55209 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
NAP1L1P55209 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
NAP1L1P55209 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
NAP1L1P55209 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
NAP1L1P55209 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC24.47■■□□□ 1.51
NAP1L1P55209 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
NAP1L1P55209 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
NAP1L1P55209 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
NAP1L1P55209 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
NAP1L1P55209 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
NAP1L1P55209 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
NAP1L1P55209 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
NAP1L1P55209 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
NAP1L1P55209 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
NAP1L1P55209 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
NAP1L1P55209 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
NAP1L1P55209 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
NAP1L1P55209 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
NAP1L1P55209 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
NAP1L1P55209 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
NAP1L1P55209 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
NAP1L1P55209 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
NAP1L1P55209 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
NAP1L1P55209 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
NAP1L1P55209 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
NAP1L1P55209 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
NAP1L1P55209 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.51
NAP1L1P55209 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
NAP1L1P55209 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
NAP1L1P55209 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
NAP1L1P55209 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
NAP1L1P55209 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
NAP1L1P55209 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
NAP1L1P55209 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
NAP1L1P55209 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
NAP1L1P55209 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
NAP1L1P55209 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
NAP1L1P55209 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
NAP1L1P55209 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
NAP1L1P55209 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
NAP1L1P55209 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
NAP1L1P55209 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
NAP1L1P55209 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
NAP1L1P55209 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
NAP1L1P55209 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
NAP1L1P55209 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
NAP1L1P55209 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
NAP1L1P55209 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
NAP1L1P55209 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
NAP1L1P55209 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
NAP1L1P55209 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
NAP1L1P55209 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
NAP1L1P55209 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
NAP1L1P55209 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
NAP1L1P55209 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
NAP1L1P55209 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
NAP1L1P55209 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
NAP1L1P55209 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
NAP1L1P55209 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
NAP1L1P55209 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
NAP1L1P55209 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
NAP1L1P55209 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
NAP1L1P55209 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
NAP1L1P55209 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
NAP1L1P55209 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
NAP1L1P55209 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
NAP1L1P55209 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
NAP1L1P55209 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
NAP1L1P55209 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
NAP1L1P55209 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.6 ms