Protein–RNA interactions for Protein: P55199

ELL, RNA polymerase II elongation factor ELL, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 621 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ELLP55199 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ELLP55199 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ELLP55199 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
ELLP55199 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ELLP55199 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
ELLP55199 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ELLP55199 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ELLP55199 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ELLP55199 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
ELLP55199 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
ELLP55199 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ELLP55199 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ELLP55199 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ELLP55199 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ELLP55199 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
ELLP55199 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ELLP55199 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ELLP55199 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
ELLP55199 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
ELLP55199 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
ELLP55199 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ELLP55199 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ELLP55199 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ELLP55199 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
ELLP55199 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
ELLP55199 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ELLP55199 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ELLP55199 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ELLP55199 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ELLP55199 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ELLP55199 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ELLP55199 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ELLP55199 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ELLP55199 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ELLP55199 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ELLP55199 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ELLP55199 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ELLP55199 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ELLP55199 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ELLP55199 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ELLP55199 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ELLP55199 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ELLP55199 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ELLP55199 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ELLP55199 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ELLP55199 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ELLP55199 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ELLP55199 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ELLP55199 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ELLP55199 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ELLP55199 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ELLP55199 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ELLP55199 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ELLP55199 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ELLP55199 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ELLP55199 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ELLP55199 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ELLP55199 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ELLP55199 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ELLP55199 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ELLP55199 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ELLP55199 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
ELLP55199 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
ELLP55199 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ELLP55199 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ELLP55199 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ELLP55199 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ELLP55199 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ELLP55199 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ELLP55199 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ELLP55199 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ELLP55199 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ELLP55199 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
ELLP55199 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
ELLP55199 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ELLP55199 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
ELLP55199 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
ELLP55199 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ELLP55199 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ELLP55199 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
ELLP55199 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
ELLP55199 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
ELLP55199 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ELLP55199 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ELLP55199 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ELLP55199 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ELLP55199 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
ELLP55199 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ELLP55199 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
ELLP55199 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
ELLP55199 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ELLP55199 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ELLP55199 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
ELLP55199 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ELLP55199 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
ELLP55199 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
ELLP55199 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ELLP55199 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ELLP55199 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
ELLP55199 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.5 ms