Protein–RNA interactions for Protein: P55040

GEM, GTP-binding protein GEM, humanhuman

Predictions only

Length 296 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GEMP55040 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
GEMP55040 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
GEMP55040 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
GEMP55040 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
GEMP55040 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
GEMP55040 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
GEMP55040 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
GEMP55040 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
GEMP55040 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
GEMP55040 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
GEMP55040 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
GEMP55040 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
GEMP55040 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
GEMP55040 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
GEMP55040 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
GEMP55040 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
GEMP55040 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
GEMP55040 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC23.17■■□□□ 1.3
GEMP55040 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
GEMP55040 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
GEMP55040 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
GEMP55040 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
GEMP55040 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
GEMP55040 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
GEMP55040 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
GEMP55040 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
GEMP55040 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
GEMP55040 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
GEMP55040 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
GEMP55040 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
GEMP55040 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
GEMP55040 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
GEMP55040 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
GEMP55040 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
GEMP55040 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
GEMP55040 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
GEMP55040 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
GEMP55040 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
GEMP55040 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
GEMP55040 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
GEMP55040 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
GEMP55040 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
GEMP55040 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
GEMP55040 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
GEMP55040 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
GEMP55040 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
GEMP55040 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
GEMP55040 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
GEMP55040 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
GEMP55040 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
GEMP55040 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
GEMP55040 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
GEMP55040 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
GEMP55040 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
GEMP55040 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
GEMP55040 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
GEMP55040 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
GEMP55040 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
GEMP55040 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
GEMP55040 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC23.13■■□□□ 1.29
GEMP55040 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
GEMP55040 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
GEMP55040 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
GEMP55040 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
GEMP55040 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
GEMP55040 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
GEMP55040 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
GEMP55040 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
GEMP55040 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
GEMP55040 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
GEMP55040 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
GEMP55040 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
GEMP55040 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
GEMP55040 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
GEMP55040 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
GEMP55040 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC23.12■■□□□ 1.29
GEMP55040 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
GEMP55040 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
GEMP55040 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
GEMP55040 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
GEMP55040 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
GEMP55040 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
GEMP55040 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC23.11■■□□□ 1.29
GEMP55040 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
GEMP55040 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
GEMP55040 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
GEMP55040 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
GEMP55040 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC23.1■■□□□ 1.29
GEMP55040 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
GEMP55040 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
GEMP55040 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
GEMP55040 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
GEMP55040 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
GEMP55040 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
GEMP55040 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
GEMP55040 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
GEMP55040 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
GEMP55040 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
GEMP55040 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
GEMP55040 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17 ms