Protein–RNA interactions for Protein: P54829

PTPN5, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 5, humanhuman

Predictions only

Length 565 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPN5P54829 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
PTPN5P54829 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC23.72■■□□□ 1.39
PTPN5P54829 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
PTPN5P54829 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
PTPN5P54829 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
PTPN5P54829 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
PTPN5P54829 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
PTPN5P54829 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
PTPN5P54829 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
PTPN5P54829 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
PTPN5P54829 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
PTPN5P54829 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
PTPN5P54829 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
PTPN5P54829 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
PTPN5P54829 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
PTPN5P54829 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
PTPN5P54829 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
PTPN5P54829 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.39
PTPN5P54829 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
PTPN5P54829 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
PTPN5P54829 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
PTPN5P54829 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
PTPN5P54829 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
PTPN5P54829 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
PTPN5P54829 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
PTPN5P54829 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
PTPN5P54829 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
PTPN5P54829 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
PTPN5P54829 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC23.69■■□□□ 1.38
PTPN5P54829 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
PTPN5P54829 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
PTPN5P54829 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
PTPN5P54829 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
PTPN5P54829 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
PTPN5P54829 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
PTPN5P54829 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
PTPN5P54829 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
PTPN5P54829 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
PTPN5P54829 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
PTPN5P54829 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
PTPN5P54829 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
PTPN5P54829 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
PTPN5P54829 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
PTPN5P54829 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
PTPN5P54829 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
PTPN5P54829 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
PTPN5P54829 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
PTPN5P54829 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC23.66■■□□□ 1.38
PTPN5P54829 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
PTPN5P54829 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
PTPN5P54829 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
PTPN5P54829 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
PTPN5P54829 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
PTPN5P54829 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
PTPN5P54829 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
PTPN5P54829 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
PTPN5P54829 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
PTPN5P54829 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
PTPN5P54829 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
PTPN5P54829 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC23.64■■□□□ 1.37
PTPN5P54829 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC23.64■■□□□ 1.37
PTPN5P54829 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
PTPN5P54829 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
PTPN5P54829 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
PTPN5P54829 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
PTPN5P54829 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
PTPN5P54829 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
PTPN5P54829 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
PTPN5P54829 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
PTPN5P54829 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
PTPN5P54829 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
PTPN5P54829 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC23.63■■□□□ 1.37
PTPN5P54829 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
PTPN5P54829 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
PTPN5P54829 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
PTPN5P54829 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
PTPN5P54829 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
PTPN5P54829 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PTPN5P54829 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PTPN5P54829 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PTPN5P54829 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
PTPN5P54829 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
PTPN5P54829 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PTPN5P54829 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
PTPN5P54829 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PTPN5P54829 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PTPN5P54829 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PTPN5P54829 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PTPN5P54829 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
PTPN5P54829 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PTPN5P54829 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PTPN5P54829 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PTPN5P54829 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PTPN5P54829 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PTPN5P54829 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PTPN5P54829 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PTPN5P54829 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PTPN5P54829 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
PTPN5P54829 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
PTPN5P54829 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.2 ms