Protein–RNA interactions for Protein: P52788

SMS, Spermine synthase, humanhuman

Predictions only

Length 366 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMSP52788 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
SMSP52788 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
SMSP52788 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SMSP52788 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SMSP52788 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SMSP52788 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
SMSP52788 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC21.32■■□□□ 1
SMSP52788 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SMSP52788 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SMSP52788 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
SMSP52788 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
SMSP52788 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SMSP52788 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SMSP52788 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
SMSP52788 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SMSP52788 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SMSP52788 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
SMSP52788 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SMSP52788 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SMSP52788 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SMSP52788 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SMSP52788 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
SMSP52788 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SMSP52788 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SMSP52788 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
SMSP52788 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SMSP52788 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
SMSP52788 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
SMSP52788 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
SMSP52788 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
SMSP52788 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SMSP52788 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SMSP52788 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
SMSP52788 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
SMSP52788 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SMSP52788 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC21.29■■□□□ 1
SMSP52788 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SMSP52788 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SMSP52788 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC21.29■■□□□ 1
SMSP52788 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC21.29■■□□□ 1
SMSP52788 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
SMSP52788 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
SMSP52788 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SMSP52788 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
SMSP52788 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SMSP52788 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC21.28■■□□□ 1
SMSP52788 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
SMSP52788 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
SMSP52788 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC21.28■■□□□ 1
SMSP52788 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SMSP52788 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SMSP52788 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC21.27■■□□□ 1
SMSP52788 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SMSP52788 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SMSP52788 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
SMSP52788 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SMSP52788 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
SMSP52788 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SMSP52788 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SMSP52788 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SMSP52788 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
SMSP52788 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SMSP52788 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SMSP52788 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SMSP52788 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
SMSP52788 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SMSP52788 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SMSP52788 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SMSP52788 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
SMSP52788 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
SMSP52788 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
SMSP52788 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SMSP52788 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SMSP52788 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SMSP52788 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
SMSP52788 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SMSP52788 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SMSP52788 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SMSP52788 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
SMSP52788 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SMSP52788 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SMSP52788 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SMSP52788 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
SMSP52788 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
SMSP52788 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC21.23■□□□□ 0.99
SMSP52788 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SMSP52788 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
SMSP52788 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SMSP52788 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SMSP52788 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SMSP52788 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SMSP52788 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
SMSP52788 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
SMSP52788 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
SMSP52788 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
SMSP52788 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SMSP52788 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
SMSP52788 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
SMSP52788 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SMSP52788 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 139.9 ms