Protein–RNA interactions for Protein: P51965

UBE2E1, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 E1, humanhuman

Predictions only

Length 193 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE2E1P51965 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
UBE2E1P51965 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
UBE2E1P51965 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
UBE2E1P51965 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
UBE2E1P51965 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
UBE2E1P51965 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
UBE2E1P51965 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
UBE2E1P51965 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
UBE2E1P51965 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
UBE2E1P51965 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
UBE2E1P51965 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
UBE2E1P51965 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
UBE2E1P51965 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
UBE2E1P51965 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
UBE2E1P51965 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
UBE2E1P51965 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
UBE2E1P51965 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
UBE2E1P51965 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
UBE2E1P51965 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
UBE2E1P51965 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
UBE2E1P51965 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
UBE2E1P51965 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
UBE2E1P51965 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
UBE2E1P51965 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
UBE2E1P51965 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
UBE2E1P51965 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
UBE2E1P51965 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
UBE2E1P51965 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
UBE2E1P51965 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
UBE2E1P51965 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
UBE2E1P51965 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
UBE2E1P51965 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
UBE2E1P51965 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
UBE2E1P51965 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
UBE2E1P51965 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
UBE2E1P51965 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
UBE2E1P51965 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
UBE2E1P51965 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
UBE2E1P51965 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
UBE2E1P51965 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
UBE2E1P51965 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
UBE2E1P51965 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
UBE2E1P51965 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
UBE2E1P51965 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
UBE2E1P51965 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
UBE2E1P51965 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
UBE2E1P51965 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
UBE2E1P51965 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
UBE2E1P51965 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
UBE2E1P51965 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
UBE2E1P51965 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
UBE2E1P51965 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
UBE2E1P51965 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
UBE2E1P51965 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
UBE2E1P51965 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
UBE2E1P51965 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
UBE2E1P51965 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
UBE2E1P51965 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
UBE2E1P51965 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
UBE2E1P51965 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
UBE2E1P51965 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
UBE2E1P51965 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
UBE2E1P51965 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
UBE2E1P51965 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
UBE2E1P51965 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
UBE2E1P51965 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
UBE2E1P51965 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
UBE2E1P51965 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
UBE2E1P51965 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
UBE2E1P51965 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
UBE2E1P51965 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
UBE2E1P51965 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
UBE2E1P51965 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
UBE2E1P51965 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
UBE2E1P51965 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
UBE2E1P51965 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
UBE2E1P51965 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
UBE2E1P51965 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
UBE2E1P51965 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
UBE2E1P51965 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
UBE2E1P51965 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
UBE2E1P51965 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
UBE2E1P51965 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
UBE2E1P51965 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
UBE2E1P51965 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC18.52■□□□□ 0.56
UBE2E1P51965 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
UBE2E1P51965 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
UBE2E1P51965 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
UBE2E1P51965 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
UBE2E1P51965 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
UBE2E1P51965 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
UBE2E1P51965 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
UBE2E1P51965 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
UBE2E1P51965 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
UBE2E1P51965 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
UBE2E1P51965 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
UBE2E1P51965 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
UBE2E1P51965 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
UBE2E1P51965 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
UBE2E1P51965 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.2 ms