Protein–RNA interactions for Protein: P51957

NEK4, Serine/threonine-protein kinase Nek4, humanhuman

Predictions only

Length 841 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEK4P51957 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
NEK4P51957 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
NEK4P51957 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
NEK4P51957 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
NEK4P51957 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
NEK4P51957 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
NEK4P51957 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC27.26■■□□□ 1.95
NEK4P51957 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
NEK4P51957 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
NEK4P51957 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC27.25■■□□□ 1.95
NEK4P51957 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
NEK4P51957 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC27.25■■□□□ 1.95
NEK4P51957 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
NEK4P51957 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
NEK4P51957 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
NEK4P51957 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
NEK4P51957 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
NEK4P51957 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
NEK4P51957 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC27.24■■□□□ 1.95
NEK4P51957 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
NEK4P51957 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
NEK4P51957 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
NEK4P51957 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
NEK4P51957 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
NEK4P51957 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC27.23■■□□□ 1.95
NEK4P51957 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC27.23■■□□□ 1.95
NEK4P51957 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
NEK4P51957 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
NEK4P51957 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC27.23■■□□□ 1.95
NEK4P51957 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
NEK4P51957 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
NEK4P51957 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
NEK4P51957 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
NEK4P51957 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC27.23■■□□□ 1.95
NEK4P51957 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
NEK4P51957 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
NEK4P51957 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
NEK4P51957 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
NEK4P51957 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
NEK4P51957 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
NEK4P51957 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
NEK4P51957 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
NEK4P51957 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC27.22■■□□□ 1.95
NEK4P51957 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC27.21■■□□□ 1.95
NEK4P51957 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
NEK4P51957 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
NEK4P51957 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
NEK4P51957 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC27.21■■□□□ 1.95
NEK4P51957 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
NEK4P51957 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
NEK4P51957 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
NEK4P51957 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
NEK4P51957 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
NEK4P51957 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
NEK4P51957 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC27.2■■□□□ 1.94
NEK4P51957 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC27.2■■□□□ 1.94
NEK4P51957 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
NEK4P51957 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.94
NEK4P51957 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
NEK4P51957 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
NEK4P51957 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
NEK4P51957 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
NEK4P51957 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC27.19■■□□□ 1.94
NEK4P51957 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
NEK4P51957 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
NEK4P51957 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC27.18■■□□□ 1.94
NEK4P51957 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
NEK4P51957 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
NEK4P51957 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
NEK4P51957 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
NEK4P51957 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
NEK4P51957 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
NEK4P51957 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
NEK4P51957 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
NEK4P51957 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
NEK4P51957 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
NEK4P51957 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC27.17■■□□□ 1.94
NEK4P51957 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
NEK4P51957 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
NEK4P51957 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
NEK4P51957 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
NEK4P51957 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC27.16■■□□□ 1.94
NEK4P51957 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
NEK4P51957 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
NEK4P51957 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
NEK4P51957 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
NEK4P51957 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
NEK4P51957 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
NEK4P51957 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
NEK4P51957 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
NEK4P51957 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC27.15■■□□□ 1.94
NEK4P51957 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
NEK4P51957 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
NEK4P51957 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
NEK4P51957 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
NEK4P51957 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC27.15■■□□□ 1.94
NEK4P51957 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
NEK4P51957 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
NEK4P51957 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
NEK4P51957 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.6 ms