Protein–RNA interactions for Protein: P51530

DNA2, DNA replication ATP-dependent helicase/nuclease DNA2, humanhuman

Predictions only

Length 1,060 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DNA2P51530 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
DNA2P51530 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
DNA2P51530 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
DNA2P51530 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
DNA2P51530 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
DNA2P51530 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
DNA2P51530 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
DNA2P51530 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
DNA2P51530 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
DNA2P51530 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
DNA2P51530 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
DNA2P51530 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
DNA2P51530 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
DNA2P51530 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
DNA2P51530 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
DNA2P51530 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
DNA2P51530 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
DNA2P51530 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
DNA2P51530 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
DNA2P51530 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
DNA2P51530 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
DNA2P51530 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
DNA2P51530 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
DNA2P51530 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
DNA2P51530 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
DNA2P51530 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
DNA2P51530 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
DNA2P51530 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
DNA2P51530 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
DNA2P51530 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
DNA2P51530 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
DNA2P51530 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
DNA2P51530 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
DNA2P51530 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
DNA2P51530 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
DNA2P51530 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
DNA2P51530 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
DNA2P51530 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
DNA2P51530 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
DNA2P51530 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
DNA2P51530 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
DNA2P51530 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
DNA2P51530 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC24.39■■□□□ 1.49
DNA2P51530 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
DNA2P51530 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
DNA2P51530 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
DNA2P51530 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
DNA2P51530 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
DNA2P51530 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
DNA2P51530 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
DNA2P51530 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
DNA2P51530 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
DNA2P51530 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
DNA2P51530 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
DNA2P51530 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
DNA2P51530 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
DNA2P51530 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
DNA2P51530 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
DNA2P51530 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC24.37■■□□□ 1.49
DNA2P51530 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC24.37■■□□□ 1.49
DNA2P51530 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
DNA2P51530 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
DNA2P51530 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
DNA2P51530 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
DNA2P51530 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
DNA2P51530 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
DNA2P51530 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
DNA2P51530 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
DNA2P51530 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
DNA2P51530 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
DNA2P51530 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC24.36■■□□□ 1.49
DNA2P51530 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
DNA2P51530 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
DNA2P51530 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
DNA2P51530 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
DNA2P51530 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
DNA2P51530 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
DNA2P51530 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
DNA2P51530 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
DNA2P51530 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
DNA2P51530 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
DNA2P51530 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
DNA2P51530 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
DNA2P51530 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
DNA2P51530 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
DNA2P51530 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
DNA2P51530 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
DNA2P51530 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
DNA2P51530 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
DNA2P51530 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
DNA2P51530 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
DNA2P51530 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
DNA2P51530 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
DNA2P51530 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
DNA2P51530 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
DNA2P51530 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
DNA2P51530 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
DNA2P51530 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
DNA2P51530 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
DNA2P51530 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.1 ms