Protein–RNA interactions for Protein: P51168

SCNN1B, Amiloride-sensitive sodium channel subunit beta, humanhuman

Predictions only

Length 640 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCNN1BP51168 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
SCNN1BP51168 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC23.33■■□□□ 1.33
SCNN1BP51168 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
SCNN1BP51168 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
SCNN1BP51168 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SCNN1BP51168 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SCNN1BP51168 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SCNN1BP51168 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SCNN1BP51168 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
SCNN1BP51168 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SCNN1BP51168 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SCNN1BP51168 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SCNN1BP51168 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
SCNN1BP51168 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SCNN1BP51168 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SCNN1BP51168 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SCNN1BP51168 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SCNN1BP51168 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SCNN1BP51168 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SCNN1BP51168 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SCNN1BP51168 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SCNN1BP51168 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SCNN1BP51168 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SCNN1BP51168 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SCNN1BP51168 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SCNN1BP51168 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
SCNN1BP51168 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SCNN1BP51168 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SCNN1BP51168 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SCNN1BP51168 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SCNN1BP51168 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SCNN1BP51168 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SCNN1BP51168 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SCNN1BP51168 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SCNN1BP51168 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SCNN1BP51168 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SCNN1BP51168 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SCNN1BP51168 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SCNN1BP51168 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SCNN1BP51168 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SCNN1BP51168 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SCNN1BP51168 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SCNN1BP51168 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
SCNN1BP51168 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SCNN1BP51168 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SCNN1BP51168 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SCNN1BP51168 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SCNN1BP51168 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SCNN1BP51168 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
SCNN1BP51168 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SCNN1BP51168 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SCNN1BP51168 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SCNN1BP51168 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
SCNN1BP51168 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SCNN1BP51168 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
SCNN1BP51168 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SCNN1BP51168 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SCNN1BP51168 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SCNN1BP51168 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
SCNN1BP51168 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SCNN1BP51168 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SCNN1BP51168 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SCNN1BP51168 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SCNN1BP51168 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SCNN1BP51168 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SCNN1BP51168 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SCNN1BP51168 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.31
SCNN1BP51168 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SCNN1BP51168 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SCNN1BP51168 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SCNN1BP51168 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SCNN1BP51168 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SCNN1BP51168 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
SCNN1BP51168 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SCNN1BP51168 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SCNN1BP51168 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SCNN1BP51168 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SCNN1BP51168 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SCNN1BP51168 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SCNN1BP51168 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SCNN1BP51168 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
SCNN1BP51168 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SCNN1BP51168 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SCNN1BP51168 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SCNN1BP51168 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SCNN1BP51168 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SCNN1BP51168 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SCNN1BP51168 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SCNN1BP51168 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SCNN1BP51168 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SCNN1BP51168 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SCNN1BP51168 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SCNN1BP51168 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SCNN1BP51168 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SCNN1BP51168 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SCNN1BP51168 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SCNN1BP51168 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SCNN1BP51168 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SCNN1BP51168 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
SCNN1BP51168 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.1 ms