Protein–RNA interactions for Protein: P51160

PDE6C, Cone cGMP-specific 3',5'-cyclic phosphodiesterase subunit alpha', humanhuman

Predictions only

Length 858 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE6CP51160 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
PDE6CP51160 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
PDE6CP51160 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
PDE6CP51160 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
PDE6CP51160 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
PDE6CP51160 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
PDE6CP51160 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
PDE6CP51160 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
PDE6CP51160 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
PDE6CP51160 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
PDE6CP51160 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
PDE6CP51160 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
PDE6CP51160 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
PDE6CP51160 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
PDE6CP51160 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
PDE6CP51160 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
PDE6CP51160 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
PDE6CP51160 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC24.66■■□□□ 1.54
PDE6CP51160 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
PDE6CP51160 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
PDE6CP51160 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
PDE6CP51160 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
PDE6CP51160 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
PDE6CP51160 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
PDE6CP51160 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
PDE6CP51160 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
PDE6CP51160 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
PDE6CP51160 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
PDE6CP51160 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
PDE6CP51160 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
PDE6CP51160 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC24.65■■□□□ 1.54
PDE6CP51160 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
PDE6CP51160 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
PDE6CP51160 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
PDE6CP51160 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
PDE6CP51160 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
PDE6CP51160 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
PDE6CP51160 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
PDE6CP51160 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.53
PDE6CP51160 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.53
PDE6CP51160 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
PDE6CP51160 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
PDE6CP51160 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
PDE6CP51160 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
PDE6CP51160 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
PDE6CP51160 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
PDE6CP51160 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
PDE6CP51160 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
PDE6CP51160 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
PDE6CP51160 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
PDE6CP51160 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC24.62■■□□□ 1.53
PDE6CP51160 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
PDE6CP51160 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
PDE6CP51160 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
PDE6CP51160 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
PDE6CP51160 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
PDE6CP51160 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
PDE6CP51160 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
PDE6CP51160 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
PDE6CP51160 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
PDE6CP51160 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
PDE6CP51160 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
PDE6CP51160 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
PDE6CP51160 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
PDE6CP51160 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
PDE6CP51160 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
PDE6CP51160 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
PDE6CP51160 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
PDE6CP51160 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
PDE6CP51160 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
PDE6CP51160 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
PDE6CP51160 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
PDE6CP51160 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
PDE6CP51160 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
PDE6CP51160 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
PDE6CP51160 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
PDE6CP51160 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
PDE6CP51160 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
PDE6CP51160 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
PDE6CP51160 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
PDE6CP51160 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
PDE6CP51160 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
PDE6CP51160 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
PDE6CP51160 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
PDE6CP51160 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
PDE6CP51160 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
PDE6CP51160 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
PDE6CP51160 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
PDE6CP51160 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
PDE6CP51160 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC24.57■■□□□ 1.52
PDE6CP51160 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
PDE6CP51160 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
PDE6CP51160 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
PDE6CP51160 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
PDE6CP51160 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
PDE6CP51160 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
PDE6CP51160 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
PDE6CP51160 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
PDE6CP51160 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
PDE6CP51160 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.6 ms