Protein–RNA interactions for Protein: P50542

PEX5, Peroxisomal targeting signal 1 receptor, humanhuman

Predictions only

Length 639 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PEX5P50542 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
PEX5P50542 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
PEX5P50542 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
PEX5P50542 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
PEX5P50542 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
PEX5P50542 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PEX5P50542 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PEX5P50542 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
PEX5P50542 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PEX5P50542 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PEX5P50542 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
PEX5P50542 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PEX5P50542 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
PEX5P50542 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
PEX5P50542 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
PEX5P50542 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
PEX5P50542 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
PEX5P50542 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
PEX5P50542 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC24.02■■□□□ 1.44
PEX5P50542 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
PEX5P50542 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
PEX5P50542 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
PEX5P50542 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
PEX5P50542 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
PEX5P50542 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
PEX5P50542 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
PEX5P50542 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
PEX5P50542 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
PEX5P50542 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
PEX5P50542 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
PEX5P50542 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
PEX5P50542 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
PEX5P50542 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
PEX5P50542 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
PEX5P50542 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
PEX5P50542 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
PEX5P50542 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
PEX5P50542 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
PEX5P50542 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
PEX5P50542 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
PEX5P50542 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
PEX5P50542 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
PEX5P50542 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PEX5P50542 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PEX5P50542 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
PEX5P50542 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PEX5P50542 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PEX5P50542 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PEX5P50542 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
PEX5P50542 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PEX5P50542 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
PEX5P50542 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
PEX5P50542 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
PEX5P50542 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
PEX5P50542 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
PEX5P50542 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
PEX5P50542 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
PEX5P50542 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
PEX5P50542 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
PEX5P50542 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
PEX5P50542 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
PEX5P50542 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
PEX5P50542 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
PEX5P50542 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
PEX5P50542 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
PEX5P50542 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
PEX5P50542 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
PEX5P50542 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC23.98■■□□□ 1.43
PEX5P50542 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
PEX5P50542 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
PEX5P50542 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
PEX5P50542 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
PEX5P50542 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
PEX5P50542 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
PEX5P50542 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
PEX5P50542 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
PEX5P50542 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
PEX5P50542 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
PEX5P50542 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
PEX5P50542 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
PEX5P50542 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
PEX5P50542 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
PEX5P50542 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
PEX5P50542 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
PEX5P50542 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
PEX5P50542 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.43
PEX5P50542 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
PEX5P50542 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
PEX5P50542 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
PEX5P50542 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
PEX5P50542 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
PEX5P50542 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
PEX5P50542 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
PEX5P50542 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC23.95■■□□□ 1.42
PEX5P50542 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
PEX5P50542 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
PEX5P50542 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
PEX5P50542 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
PEX5P50542 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
PEX5P50542 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 91.8 ms