Protein–RNA interactions for Protein: P49662

CASP4, Caspase-4, humanhuman

Predictions only

Length 377 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASP4P49662 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CASP4P49662 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CASP4P49662 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CASP4P49662 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
CASP4P49662 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
CASP4P49662 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
CASP4P49662 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CASP4P49662 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
CASP4P49662 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
CASP4P49662 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CASP4P49662 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
CASP4P49662 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC25.01■■□□□ 1.59
CASP4P49662 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
CASP4P49662 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CASP4P49662 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
CASP4P49662 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CASP4P49662 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
CASP4P49662 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CASP4P49662 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
CASP4P49662 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CASP4P49662 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
CASP4P49662 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CASP4P49662 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CASP4P49662 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CASP4P49662 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CASP4P49662 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
CASP4P49662 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
CASP4P49662 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
CASP4P49662 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
CASP4P49662 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
CASP4P49662 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
CASP4P49662 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC24.99■■□□□ 1.59
CASP4P49662 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
CASP4P49662 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC24.99■■□□□ 1.59
CASP4P49662 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
CASP4P49662 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
CASP4P49662 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CASP4P49662 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
CASP4P49662 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
CASP4P49662 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
CASP4P49662 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
CASP4P49662 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
CASP4P49662 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CASP4P49662 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CASP4P49662 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CASP4P49662 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CASP4P49662 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
CASP4P49662 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
CASP4P49662 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CASP4P49662 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CASP4P49662 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
CASP4P49662 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
CASP4P49662 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CASP4P49662 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
CASP4P49662 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
CASP4P49662 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
CASP4P49662 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CASP4P49662 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CASP4P49662 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CASP4P49662 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CASP4P49662 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
CASP4P49662 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CASP4P49662 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CASP4P49662 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CASP4P49662 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
CASP4P49662 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
CASP4P49662 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC24.96■■□□□ 1.59
CASP4P49662 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
CASP4P49662 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC24.96■■□□□ 1.59
CASP4P49662 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC24.96■■□□□ 1.59
CASP4P49662 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CASP4P49662 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CASP4P49662 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CASP4P49662 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CASP4P49662 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CASP4P49662 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
CASP4P49662 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
CASP4P49662 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
CASP4P49662 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
CASP4P49662 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
CASP4P49662 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
CASP4P49662 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
CASP4P49662 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
CASP4P49662 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
CASP4P49662 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
CASP4P49662 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
CASP4P49662 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
CASP4P49662 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
CASP4P49662 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CASP4P49662 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CASP4P49662 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CASP4P49662 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CASP4P49662 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
CASP4P49662 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CASP4P49662 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CASP4P49662 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC24.93■■□□□ 1.58
CASP4P49662 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CASP4P49662 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC24.93■■□□□ 1.58
CASP4P49662 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CASP4P49662 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.1 ms