Protein–RNA interactions for Protein: P48995

TRPC1, Short transient receptor potential channel 1, humanhuman

Predictions only

Length 793 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRPC1P48995 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
TRPC1P48995 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
TRPC1P48995 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
TRPC1P48995 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
TRPC1P48995 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
TRPC1P48995 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
TRPC1P48995 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
TRPC1P48995 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
TRPC1P48995 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
TRPC1P48995 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
TRPC1P48995 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
TRPC1P48995 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
TRPC1P48995 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
TRPC1P48995 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
TRPC1P48995 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
TRPC1P48995 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
TRPC1P48995 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
TRPC1P48995 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
TRPC1P48995 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
TRPC1P48995 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
TRPC1P48995 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
TRPC1P48995 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
TRPC1P48995 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
TRPC1P48995 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
TRPC1P48995 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
TRPC1P48995 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
TRPC1P48995 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
TRPC1P48995 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
TRPC1P48995 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
TRPC1P48995 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
TRPC1P48995 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
TRPC1P48995 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
TRPC1P48995 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
TRPC1P48995 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
TRPC1P48995 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
TRPC1P48995 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
TRPC1P48995 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
TRPC1P48995 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
TRPC1P48995 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
TRPC1P48995 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
TRPC1P48995 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
TRPC1P48995 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
TRPC1P48995 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
TRPC1P48995 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
TRPC1P48995 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
TRPC1P48995 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
TRPC1P48995 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
TRPC1P48995 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
TRPC1P48995 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
TRPC1P48995 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
TRPC1P48995 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
TRPC1P48995 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
TRPC1P48995 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
TRPC1P48995 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
TRPC1P48995 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
TRPC1P48995 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
TRPC1P48995 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
TRPC1P48995 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
TRPC1P48995 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
TRPC1P48995 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
TRPC1P48995 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
TRPC1P48995 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
TRPC1P48995 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
TRPC1P48995 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
TRPC1P48995 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
TRPC1P48995 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
TRPC1P48995 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
TRPC1P48995 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
TRPC1P48995 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
TRPC1P48995 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
TRPC1P48995 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
TRPC1P48995 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC21.82■■□□□ 1.08
TRPC1P48995 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
TRPC1P48995 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
TRPC1P48995 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
TRPC1P48995 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
TRPC1P48995 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
TRPC1P48995 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
TRPC1P48995 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
TRPC1P48995 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
TRPC1P48995 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
TRPC1P48995 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
TRPC1P48995 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
TRPC1P48995 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
TRPC1P48995 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
TRPC1P48995 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
TRPC1P48995 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC21.81■■□□□ 1.08
TRPC1P48995 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
TRPC1P48995 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
TRPC1P48995 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
TRPC1P48995 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
TRPC1P48995 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
TRPC1P48995 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
TRPC1P48995 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
TRPC1P48995 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
TRPC1P48995 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
TRPC1P48995 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
TRPC1P48995 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
TRPC1P48995 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
TRPC1P48995 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.6 ms