Protein–RNA interactions for Protein: P47972

NPTX2, Neuronal pentraxin-2, humanhuman

Predictions only

Length 431 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NPTX2P47972 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
NPTX2P47972 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
NPTX2P47972 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
NPTX2P47972 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
NPTX2P47972 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
NPTX2P47972 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
NPTX2P47972 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
NPTX2P47972 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
NPTX2P47972 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
NPTX2P47972 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
NPTX2P47972 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
NPTX2P47972 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
NPTX2P47972 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
NPTX2P47972 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
NPTX2P47972 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
NPTX2P47972 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
NPTX2P47972 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
NPTX2P47972 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
NPTX2P47972 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
NPTX2P47972 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
NPTX2P47972 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
NPTX2P47972 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
NPTX2P47972 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
NPTX2P47972 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
NPTX2P47972 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
NPTX2P47972 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
NPTX2P47972 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
NPTX2P47972 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
NPTX2P47972 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
NPTX2P47972 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
NPTX2P47972 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
NPTX2P47972 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
NPTX2P47972 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
NPTX2P47972 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
NPTX2P47972 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
NPTX2P47972 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
NPTX2P47972 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
NPTX2P47972 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
NPTX2P47972 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
NPTX2P47972 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
NPTX2P47972 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
NPTX2P47972 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
NPTX2P47972 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
NPTX2P47972 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
NPTX2P47972 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
NPTX2P47972 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
NPTX2P47972 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
NPTX2P47972 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
NPTX2P47972 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
NPTX2P47972 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
NPTX2P47972 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
NPTX2P47972 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
NPTX2P47972 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
NPTX2P47972 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
NPTX2P47972 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
NPTX2P47972 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
NPTX2P47972 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
NPTX2P47972 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
NPTX2P47972 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
NPTX2P47972 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
NPTX2P47972 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
NPTX2P47972 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
NPTX2P47972 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
NPTX2P47972 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
NPTX2P47972 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
NPTX2P47972 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
NPTX2P47972 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
NPTX2P47972 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
NPTX2P47972 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
NPTX2P47972 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
NPTX2P47972 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
NPTX2P47972 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
NPTX2P47972 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
NPTX2P47972 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
NPTX2P47972 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
NPTX2P47972 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
NPTX2P47972 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
NPTX2P47972 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
NPTX2P47972 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
NPTX2P47972 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
NPTX2P47972 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
NPTX2P47972 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
NPTX2P47972 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
NPTX2P47972 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
NPTX2P47972 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
NPTX2P47972 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
NPTX2P47972 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
NPTX2P47972 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
NPTX2P47972 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC25.14■■□□□ 1.62
NPTX2P47972 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
NPTX2P47972 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
NPTX2P47972 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC25.14■■□□□ 1.62
NPTX2P47972 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
NPTX2P47972 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.61
NPTX2P47972 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
NPTX2P47972 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
NPTX2P47972 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
NPTX2P47972 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
NPTX2P47972 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
NPTX2P47972 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16 ms