Protein–RNA interactions for Protein: P43405

SYK, Tyrosine-protein kinase SYK, humanhuman

Predictions only

Length 635 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYKP43405 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC25.87■■□□□ 1.73
SYKP43405 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
SYKP43405 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
SYKP43405 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
SYKP43405 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
SYKP43405 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC25.87■■□□□ 1.73
SYKP43405 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC25.86■■□□□ 1.73
SYKP43405 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
SYKP43405 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
SYKP43405 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC25.86■■□□□ 1.73
SYKP43405 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
SYKP43405 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
SYKP43405 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
SYKP43405 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
SYKP43405 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
SYKP43405 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
SYKP43405 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC25.85■■□□□ 1.73
SYKP43405 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
SYKP43405 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
SYKP43405 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
SYKP43405 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
SYKP43405 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
SYKP43405 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC25.84■■□□□ 1.73
SYKP43405 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
SYKP43405 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC25.84■■□□□ 1.73
SYKP43405 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
SYKP43405 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
SYKP43405 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
SYKP43405 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
SYKP43405 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
SYKP43405 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
SYKP43405 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
SYKP43405 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
SYKP43405 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
SYKP43405 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC25.83■■□□□ 1.73
SYKP43405 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
SYKP43405 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
SYKP43405 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
SYKP43405 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
SYKP43405 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
SYKP43405 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
SYKP43405 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
SYKP43405 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
SYKP43405 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
SYKP43405 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.82■■□□□ 1.72
SYKP43405 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
SYKP43405 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
SYKP43405 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
SYKP43405 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
SYKP43405 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
SYKP43405 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
SYKP43405 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
SYKP43405 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
SYKP43405 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
SYKP43405 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
SYKP43405 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
SYKP43405 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC25.81■■□□□ 1.72
SYKP43405 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
SYKP43405 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
SYKP43405 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
SYKP43405 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
SYKP43405 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
SYKP43405 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
SYKP43405 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
SYKP43405 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
SYKP43405 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
SYKP43405 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
SYKP43405 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
SYKP43405 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
SYKP43405 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
SYKP43405 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC25.8■■□□□ 1.72
SYKP43405 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
SYKP43405 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
SYKP43405 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
SYKP43405 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
SYKP43405 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
SYKP43405 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
SYKP43405 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC25.79■■□□□ 1.72
SYKP43405 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC25.79■■□□□ 1.72
SYKP43405 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
SYKP43405 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
SYKP43405 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
SYKP43405 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC25.78■■□□□ 1.72
SYKP43405 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
SYKP43405 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
SYKP43405 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
SYKP43405 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
SYKP43405 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
SYKP43405 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
SYKP43405 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC25.77■■□□□ 1.72
SYKP43405 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC25.77■■□□□ 1.72
SYKP43405 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
SYKP43405 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
SYKP43405 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
SYKP43405 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
SYKP43405 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
SYKP43405 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
SYKP43405 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
SYKP43405 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
SYKP43405 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.2 ms