Protein–RNA interactions for Protein: P43268

ETV4, ETS translocation variant 4, humanhuman

Predictions only

Length 484 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ETV4P43268 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ETV4P43268 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ETV4P43268 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
ETV4P43268 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ETV4P43268 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
ETV4P43268 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
ETV4P43268 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ETV4P43268 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ETV4P43268 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
ETV4P43268 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ETV4P43268 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ETV4P43268 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
ETV4P43268 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ETV4P43268 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ETV4P43268 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ETV4P43268 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
ETV4P43268 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
ETV4P43268 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
ETV4P43268 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
ETV4P43268 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ETV4P43268 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ETV4P43268 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
ETV4P43268 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
ETV4P43268 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ETV4P43268 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
ETV4P43268 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ETV4P43268 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ETV4P43268 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
ETV4P43268 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ETV4P43268 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
ETV4P43268 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
ETV4P43268 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
ETV4P43268 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
ETV4P43268 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
ETV4P43268 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
ETV4P43268 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
ETV4P43268 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
ETV4P43268 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
ETV4P43268 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
ETV4P43268 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
ETV4P43268 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ETV4P43268 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ETV4P43268 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
ETV4P43268 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
ETV4P43268 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
ETV4P43268 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
ETV4P43268 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ETV4P43268 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ETV4P43268 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ETV4P43268 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ETV4P43268 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ETV4P43268 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
ETV4P43268 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
ETV4P43268 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
ETV4P43268 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
ETV4P43268 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
ETV4P43268 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
ETV4P43268 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ETV4P43268 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
ETV4P43268 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ETV4P43268 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
ETV4P43268 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
ETV4P43268 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ETV4P43268 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ETV4P43268 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
ETV4P43268 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
ETV4P43268 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
ETV4P43268 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
ETV4P43268 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
ETV4P43268 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
ETV4P43268 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC22.61■■□□□ 1.21
ETV4P43268 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
ETV4P43268 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
ETV4P43268 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
ETV4P43268 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
ETV4P43268 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
ETV4P43268 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ETV4P43268 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
ETV4P43268 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ETV4P43268 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ETV4P43268 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
ETV4P43268 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ETV4P43268 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ETV4P43268 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
ETV4P43268 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
ETV4P43268 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ETV4P43268 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ETV4P43268 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
ETV4P43268 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ETV4P43268 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ETV4P43268 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
ETV4P43268 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ETV4P43268 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ETV4P43268 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
ETV4P43268 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
ETV4P43268 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
ETV4P43268 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ETV4P43268 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ETV4P43268 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
ETV4P43268 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.6 ms