Protein–RNA interactions for Protein: P43155

CRAT, Carnitine O-acetyltransferase, humanhuman

Predictions only

Length 626 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRATP43155 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CRATP43155 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CRATP43155 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CRATP43155 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CRATP43155 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CRATP43155 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CRATP43155 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CRATP43155 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CRATP43155 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
CRATP43155 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
CRATP43155 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CRATP43155 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CRATP43155 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CRATP43155 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CRATP43155 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CRATP43155 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
CRATP43155 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CRATP43155 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CRATP43155 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CRATP43155 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CRATP43155 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CRATP43155 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CRATP43155 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CRATP43155 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CRATP43155 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CRATP43155 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CRATP43155 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CRATP43155 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CRATP43155 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CRATP43155 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CRATP43155 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CRATP43155 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CRATP43155 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CRATP43155 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CRATP43155 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CRATP43155 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CRATP43155 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CRATP43155 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CRATP43155 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CRATP43155 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CRATP43155 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CRATP43155 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CRATP43155 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CRATP43155 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CRATP43155 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CRATP43155 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CRATP43155 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CRATP43155 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CRATP43155 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CRATP43155 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CRATP43155 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CRATP43155 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CRATP43155 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
CRATP43155 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CRATP43155 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CRATP43155 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
CRATP43155 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CRATP43155 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CRATP43155 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CRATP43155 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CRATP43155 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CRATP43155 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CRATP43155 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CRATP43155 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CRATP43155 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CRATP43155 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CRATP43155 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CRATP43155 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
CRATP43155 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CRATP43155 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CRATP43155 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CRATP43155 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CRATP43155 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CRATP43155 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CRATP43155 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CRATP43155 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
CRATP43155 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CRATP43155 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CRATP43155 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CRATP43155 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CRATP43155 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CRATP43155 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CRATP43155 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CRATP43155 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CRATP43155 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CRATP43155 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CRATP43155 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
CRATP43155 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CRATP43155 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CRATP43155 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CRATP43155 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CRATP43155 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CRATP43155 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CRATP43155 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CRATP43155 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CRATP43155 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CRATP43155 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CRATP43155 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CRATP43155 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CRATP43155 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.7 ms