Protein–RNA interactions for Protein: P43026

GDF5, Growth/differentiation factor 5, humanhuman

Predictions only

Length 501 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GDF5P43026 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
GDF5P43026 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
GDF5P43026 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
GDF5P43026 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
GDF5P43026 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
GDF5P43026 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
GDF5P43026 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
GDF5P43026 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
GDF5P43026 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
GDF5P43026 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
GDF5P43026 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
GDF5P43026 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
GDF5P43026 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
GDF5P43026 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
GDF5P43026 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
GDF5P43026 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
GDF5P43026 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
GDF5P43026 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
GDF5P43026 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
GDF5P43026 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
GDF5P43026 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
GDF5P43026 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
GDF5P43026 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
GDF5P43026 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
GDF5P43026 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
GDF5P43026 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
GDF5P43026 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
GDF5P43026 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.15
GDF5P43026 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
GDF5P43026 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
GDF5P43026 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
GDF5P43026 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
GDF5P43026 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
GDF5P43026 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
GDF5P43026 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
GDF5P43026 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
GDF5P43026 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
GDF5P43026 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
GDF5P43026 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
GDF5P43026 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
GDF5P43026 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
GDF5P43026 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
GDF5P43026 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
GDF5P43026 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
GDF5P43026 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
GDF5P43026 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
GDF5P43026 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
GDF5P43026 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
GDF5P43026 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
GDF5P43026 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
GDF5P43026 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
GDF5P43026 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
GDF5P43026 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
GDF5P43026 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
GDF5P43026 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
GDF5P43026 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
GDF5P43026 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
GDF5P43026 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
GDF5P43026 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
GDF5P43026 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
GDF5P43026 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
GDF5P43026 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
GDF5P43026 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
GDF5P43026 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
GDF5P43026 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
GDF5P43026 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
GDF5P43026 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
GDF5P43026 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
GDF5P43026 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
GDF5P43026 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.15
GDF5P43026 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
GDF5P43026 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
GDF5P43026 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
GDF5P43026 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
GDF5P43026 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
GDF5P43026 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
GDF5P43026 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
GDF5P43026 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
GDF5P43026 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
GDF5P43026 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
GDF5P43026 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
GDF5P43026 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
GDF5P43026 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
GDF5P43026 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
GDF5P43026 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
GDF5P43026 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
GDF5P43026 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
GDF5P43026 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
GDF5P43026 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
GDF5P43026 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
GDF5P43026 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
GDF5P43026 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
GDF5P43026 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
GDF5P43026 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
GDF5P43026 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
GDF5P43026 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
GDF5P43026 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
GDF5P43026 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
GDF5P43026 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
GDF5P43026 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13 ms