Protein–RNA interactions for Protein: P41219

PRPH, Peripherin, humanhuman

Predictions only

Length 470 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRPHP41219 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.73
PRPHP41219 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.73
PRPHP41219 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.73
PRPHP41219 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC25.89■■□□□ 1.73
PRPHP41219 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.73
PRPHP41219 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.73
PRPHP41219 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
PRPHP41219 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
PRPHP41219 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
PRPHP41219 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
PRPHP41219 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
PRPHP41219 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
PRPHP41219 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
PRPHP41219 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
PRPHP41219 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
PRPHP41219 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
PRPHP41219 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
PRPHP41219 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
PRPHP41219 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
PRPHP41219 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
PRPHP41219 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
PRPHP41219 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
PRPHP41219 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
PRPHP41219 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC25.87■■□□□ 1.73
PRPHP41219 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
PRPHP41219 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
PRPHP41219 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
PRPHP41219 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
PRPHP41219 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
PRPHP41219 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
PRPHP41219 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
PRPHP41219 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
PRPHP41219 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
PRPHP41219 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
PRPHP41219 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
PRPHP41219 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
PRPHP41219 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
PRPHP41219 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
PRPHP41219 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
PRPHP41219 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
PRPHP41219 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
PRPHP41219 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
PRPHP41219 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
PRPHP41219 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
PRPHP41219 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
PRPHP41219 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
PRPHP41219 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
PRPHP41219 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
PRPHP41219 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC25.84■■□□□ 1.73
PRPHP41219 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
PRPHP41219 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC25.84■■□□□ 1.73
PRPHP41219 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
PRPHP41219 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
PRPHP41219 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
PRPHP41219 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
PRPHP41219 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
PRPHP41219 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
PRPHP41219 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
PRPHP41219 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.72
PRPHP41219 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
PRPHP41219 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
PRPHP41219 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
PRPHP41219 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.81■■□□□ 1.72
PRPHP41219 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
PRPHP41219 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
PRPHP41219 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
PRPHP41219 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
PRPHP41219 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
PRPHP41219 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
PRPHP41219 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
PRPHP41219 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
PRPHP41219 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
PRPHP41219 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
PRPHP41219 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
PRPHP41219 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
PRPHP41219 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
PRPHP41219 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
PRPHP41219 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
PRPHP41219 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
PRPHP41219 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
PRPHP41219 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
PRPHP41219 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
PRPHP41219 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
PRPHP41219 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
PRPHP41219 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
PRPHP41219 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
PRPHP41219 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
PRPHP41219 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
PRPHP41219 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
PRPHP41219 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
PRPHP41219 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
PRPHP41219 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
PRPHP41219 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
PRPHP41219 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
PRPHP41219 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
PRPHP41219 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
PRPHP41219 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
PRPHP41219 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
PRPHP41219 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
PRPHP41219 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.8 ms