Protein–RNA interactions for Protein: P40424

PBX1, Pre-B-cell leukemia transcription factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 430 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PBX1P40424 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
PBX1P40424 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
PBX1P40424 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
PBX1P40424 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
PBX1P40424 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
PBX1P40424 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
PBX1P40424 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
PBX1P40424 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
PBX1P40424 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
PBX1P40424 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC24.95■■□□□ 1.58
PBX1P40424 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
PBX1P40424 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
PBX1P40424 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
PBX1P40424 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
PBX1P40424 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
PBX1P40424 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
PBX1P40424 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
PBX1P40424 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
PBX1P40424 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
PBX1P40424 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
PBX1P40424 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
PBX1P40424 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
PBX1P40424 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
PBX1P40424 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
PBX1P40424 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
PBX1P40424 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC24.93■■□□□ 1.58
PBX1P40424 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
PBX1P40424 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
PBX1P40424 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
PBX1P40424 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
PBX1P40424 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
PBX1P40424 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
PBX1P40424 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
PBX1P40424 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
PBX1P40424 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
PBX1P40424 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
PBX1P40424 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
PBX1P40424 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
PBX1P40424 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
PBX1P40424 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
PBX1P40424 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
PBX1P40424 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
PBX1P40424 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
PBX1P40424 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
PBX1P40424 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
PBX1P40424 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
PBX1P40424 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
PBX1P40424 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
PBX1P40424 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
PBX1P40424 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
PBX1P40424 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
PBX1P40424 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
PBX1P40424 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
PBX1P40424 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
PBX1P40424 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
PBX1P40424 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.58
PBX1P40424 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
PBX1P40424 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
PBX1P40424 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
PBX1P40424 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
PBX1P40424 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
PBX1P40424 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
PBX1P40424 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
PBX1P40424 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
PBX1P40424 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
PBX1P40424 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
PBX1P40424 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
PBX1P40424 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
PBX1P40424 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
PBX1P40424 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
PBX1P40424 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
PBX1P40424 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
PBX1P40424 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
PBX1P40424 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
PBX1P40424 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
PBX1P40424 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
PBX1P40424 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
PBX1P40424 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
PBX1P40424 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
PBX1P40424 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
PBX1P40424 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
PBX1P40424 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
PBX1P40424 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
PBX1P40424 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
PBX1P40424 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
PBX1P40424 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
PBX1P40424 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
PBX1P40424 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
PBX1P40424 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
PBX1P40424 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
PBX1P40424 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
PBX1P40424 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
PBX1P40424 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
PBX1P40424 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
PBX1P40424 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
PBX1P40424 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
PBX1P40424 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
PBX1P40424 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
PBX1P40424 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
PBX1P40424 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.2 ms