Protein–RNA interactions for Protein: P40306

PSMB10, Proteasome subunit beta type-10, humanhuman

Predictions only

Length 273 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMB10P40306 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
PSMB10P40306 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
PSMB10P40306 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
PSMB10P40306 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
PSMB10P40306 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
PSMB10P40306 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC20.26■□□□□ 0.83
PSMB10P40306 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC20.26■□□□□ 0.83
PSMB10P40306 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
PSMB10P40306 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC20.26■□□□□ 0.83
PSMB10P40306 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
PSMB10P40306 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
PSMB10P40306 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
PSMB10P40306 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
PSMB10P40306 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
PSMB10P40306 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
PSMB10P40306 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
PSMB10P40306 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
PSMB10P40306 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
PSMB10P40306 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
PSMB10P40306 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
PSMB10P40306 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
PSMB10P40306 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
PSMB10P40306 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
PSMB10P40306 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
PSMB10P40306 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
PSMB10P40306 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
PSMB10P40306 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
PSMB10P40306 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
PSMB10P40306 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
PSMB10P40306 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
PSMB10P40306 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
PSMB10P40306 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
PSMB10P40306 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
PSMB10P40306 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
PSMB10P40306 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
PSMB10P40306 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
PSMB10P40306 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
PSMB10P40306 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
PSMB10P40306 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
PSMB10P40306 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
PSMB10P40306 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
PSMB10P40306 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
PSMB10P40306 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
PSMB10P40306 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
PSMB10P40306 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
PSMB10P40306 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC20.23■□□□□ 0.83
PSMB10P40306 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
PSMB10P40306 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
PSMB10P40306 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
PSMB10P40306 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
PSMB10P40306 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
PSMB10P40306 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
PSMB10P40306 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
PSMB10P40306 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
PSMB10P40306 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
PSMB10P40306 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
PSMB10P40306 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
PSMB10P40306 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
PSMB10P40306 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
PSMB10P40306 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
PSMB10P40306 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
PSMB10P40306 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
PSMB10P40306 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
PSMB10P40306 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC20.22■□□□□ 0.83
PSMB10P40306 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
PSMB10P40306 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
PSMB10P40306 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
PSMB10P40306 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
PSMB10P40306 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
PSMB10P40306 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
PSMB10P40306 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
PSMB10P40306 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
PSMB10P40306 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
PSMB10P40306 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
PSMB10P40306 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
PSMB10P40306 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
PSMB10P40306 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
PSMB10P40306 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
PSMB10P40306 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
PSMB10P40306 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
PSMB10P40306 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
PSMB10P40306 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
PSMB10P40306 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
PSMB10P40306 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
PSMB10P40306 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PSMB10P40306 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PSMB10P40306 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PSMB10P40306 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
PSMB10P40306 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
PSMB10P40306 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC20.19■□□□□ 0.82
PSMB10P40306 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PSMB10P40306 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PSMB10P40306 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PSMB10P40306 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PSMB10P40306 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
PSMB10P40306 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PSMB10P40306 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PSMB10P40306 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
PSMB10P40306 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
PSMB10P40306 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56 ms