Protein–RNA interactions for Protein: P39900

MMP12, Macrophage metalloelastase, humanhuman

Predictions only

Length 470 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MMP12P39900 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
MMP12P39900 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
MMP12P39900 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
MMP12P39900 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
MMP12P39900 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
MMP12P39900 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
MMP12P39900 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
MMP12P39900 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
MMP12P39900 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
MMP12P39900 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
MMP12P39900 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
MMP12P39900 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
MMP12P39900 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
MMP12P39900 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
MMP12P39900 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
MMP12P39900 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
MMP12P39900 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
MMP12P39900 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
MMP12P39900 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
MMP12P39900 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
MMP12P39900 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
MMP12P39900 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
MMP12P39900 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
MMP12P39900 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
MMP12P39900 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
MMP12P39900 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
MMP12P39900 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
MMP12P39900 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
MMP12P39900 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
MMP12P39900 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
MMP12P39900 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
MMP12P39900 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
MMP12P39900 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
MMP12P39900 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
MMP12P39900 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
MMP12P39900 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
MMP12P39900 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
MMP12P39900 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
MMP12P39900 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
MMP12P39900 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
MMP12P39900 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
MMP12P39900 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
MMP12P39900 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
MMP12P39900 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
MMP12P39900 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
MMP12P39900 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
MMP12P39900 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
MMP12P39900 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
MMP12P39900 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
MMP12P39900 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
MMP12P39900 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
MMP12P39900 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
MMP12P39900 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
MMP12P39900 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
MMP12P39900 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
MMP12P39900 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
MMP12P39900 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
MMP12P39900 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
MMP12P39900 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
MMP12P39900 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
MMP12P39900 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
MMP12P39900 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
MMP12P39900 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
MMP12P39900 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
MMP12P39900 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
MMP12P39900 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
MMP12P39900 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
MMP12P39900 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
MMP12P39900 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
MMP12P39900 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
MMP12P39900 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
MMP12P39900 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
MMP12P39900 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
MMP12P39900 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
MMP12P39900 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
MMP12P39900 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
MMP12P39900 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
MMP12P39900 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
MMP12P39900 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
MMP12P39900 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
MMP12P39900 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
MMP12P39900 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
MMP12P39900 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
MMP12P39900 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
MMP12P39900 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
MMP12P39900 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
MMP12P39900 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
MMP12P39900 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
MMP12P39900 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
MMP12P39900 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
MMP12P39900 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
MMP12P39900 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
MMP12P39900 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
MMP12P39900 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
MMP12P39900 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
MMP12P39900 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
MMP12P39900 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
MMP12P39900 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
MMP12P39900 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
MMP12P39900 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.2 ms