Protein–RNA interactions for Protein: P37198

NUP62, Nuclear pore glycoprotein p62, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 522 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUP62P37198 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
NUP62P37198 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
NUP62P37198 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
NUP62P37198 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
NUP62P37198 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
NUP62P37198 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
NUP62P37198 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
NUP62P37198 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
NUP62P37198 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
NUP62P37198 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
NUP62P37198 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
NUP62P37198 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
NUP62P37198 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
NUP62P37198 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
NUP62P37198 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
NUP62P37198 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
NUP62P37198 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
NUP62P37198 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
NUP62P37198 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
NUP62P37198 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
NUP62P37198 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
NUP62P37198 ZSWIM5-201ENST00000359600 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
NUP62P37198 AGFG2-201ENST00000300176 4796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
NUP62P37198 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC19.23■□□□□ 0.67
NUP62P37198 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
NUP62P37198 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC19.23■□□□□ 0.67
NUP62P37198 AGO4-201ENST00000373210 7116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
NUP62P37198 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
NUP62P37198 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
NUP62P37198 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.23■□□□□ 0.67
NUP62P37198 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
NUP62P37198 ITPKB-203ENST00000429204 6162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
NUP62P37198 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
NUP62P37198 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
NUP62P37198 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
NUP62P37198 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
NUP62P37198 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
NUP62P37198 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
NUP62P37198 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
NUP62P37198 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
NUP62P37198 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
NUP62P37198 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
NUP62P37198 PNMA8B-202ENST00000599531 5308 ntAPPRIS P1 BASIC19.21■□□□□ 0.67
NUP62P37198 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
NUP62P37198 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
NUP62P37198 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
NUP62P37198 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
NUP62P37198 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
NUP62P37198 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
NUP62P37198 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
NUP62P37198 SPTBN4-202ENST00000352632 8676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
NUP62P37198 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
NUP62P37198 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
NUP62P37198 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
NUP62P37198 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
NUP62P37198 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
NUP62P37198 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
NUP62P37198 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
NUP62P37198 WDR90-201ENST00000293879 5488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
NUP62P37198 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
NUP62P37198 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
NUP62P37198 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
NUP62P37198 SUDS3-204ENST00000543473 4897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
NUP62P37198 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
NUP62P37198 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
NUP62P37198 PHLDA1-202ENST00000602540 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
NUP62P37198 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
NUP62P37198 KLHDC10-201ENST00000335420 6437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
NUP62P37198 PPTC7-201ENST00000354300 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
NUP62P37198 KDM5C-203ENST00000375383 5122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
NUP62P37198 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
NUP62P37198 RIMKLB-202ENST00000357529 5830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
NUP62P37198 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
NUP62P37198 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
NUP62P37198 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
NUP62P37198 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
NUP62P37198 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
NUP62P37198 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
NUP62P37198 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
NUP62P37198 TBC1D2B-202ENST00000409931 6086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
NUP62P37198 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
NUP62P37198 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
NUP62P37198 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
NUP62P37198 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
NUP62P37198 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
NUP62P37198 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
NUP62P37198 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
NUP62P37198 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
NUP62P37198 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
NUP62P37198 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
NUP62P37198 GALNT10-201ENST00000297107 5961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
NUP62P37198 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
NUP62P37198 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
NUP62P37198 RAI14-201ENST00000265109 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
NUP62P37198 TGFBR1-201ENST00000374990 5720 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
NUP62P37198 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
NUP62P37198 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
NUP62P37198 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
NUP62P37198 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
NUP62P37198 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 298.5 ms