Protein–RNA interactions for Protein: P36954

POLR2I, DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB9, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 125 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR2IP36954 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
POLR2IP36954 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
POLR2IP36954 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
POLR2IP36954 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
POLR2IP36954 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
POLR2IP36954 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
POLR2IP36954 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC21.08■□□□□ 0.97
POLR2IP36954 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
POLR2IP36954 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
POLR2IP36954 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
POLR2IP36954 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
POLR2IP36954 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.96
POLR2IP36954 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
POLR2IP36954 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
POLR2IP36954 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
POLR2IP36954 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
POLR2IP36954 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
POLR2IP36954 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
POLR2IP36954 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
POLR2IP36954 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
POLR2IP36954 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
POLR2IP36954 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
POLR2IP36954 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC21.07■□□□□ 0.96
POLR2IP36954 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
POLR2IP36954 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
POLR2IP36954 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
POLR2IP36954 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
POLR2IP36954 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
POLR2IP36954 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
POLR2IP36954 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
POLR2IP36954 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.06■□□□□ 0.96
POLR2IP36954 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
POLR2IP36954 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
POLR2IP36954 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
POLR2IP36954 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
POLR2IP36954 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
POLR2IP36954 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
POLR2IP36954 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
POLR2IP36954 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
POLR2IP36954 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
POLR2IP36954 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
POLR2IP36954 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
POLR2IP36954 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
POLR2IP36954 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
POLR2IP36954 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
POLR2IP36954 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
POLR2IP36954 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
POLR2IP36954 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
POLR2IP36954 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
POLR2IP36954 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
POLR2IP36954 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
POLR2IP36954 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
POLR2IP36954 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
POLR2IP36954 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
POLR2IP36954 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.04■□□□□ 0.96
POLR2IP36954 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
POLR2IP36954 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
POLR2IP36954 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
POLR2IP36954 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
POLR2IP36954 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
POLR2IP36954 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
POLR2IP36954 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
POLR2IP36954 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
POLR2IP36954 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
POLR2IP36954 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
POLR2IP36954 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
POLR2IP36954 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
POLR2IP36954 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
POLR2IP36954 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
POLR2IP36954 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
POLR2IP36954 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
POLR2IP36954 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC21.02■□□□□ 0.96
POLR2IP36954 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
POLR2IP36954 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
POLR2IP36954 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC21.02■□□□□ 0.96
POLR2IP36954 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC21.02■□□□□ 0.96
POLR2IP36954 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
POLR2IP36954 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
POLR2IP36954 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
POLR2IP36954 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC21.02■□□□□ 0.96
POLR2IP36954 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
POLR2IP36954 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
POLR2IP36954 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
POLR2IP36954 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
POLR2IP36954 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
POLR2IP36954 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
POLR2IP36954 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
POLR2IP36954 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
POLR2IP36954 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
POLR2IP36954 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC21.01■□□□□ 0.95
POLR2IP36954 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
POLR2IP36954 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
POLR2IP36954 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC21■□□□□ 0.95
POLR2IP36954 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC21■□□□□ 0.95
POLR2IP36954 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
POLR2IP36954 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
POLR2IP36954 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
POLR2IP36954 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
POLR2IP36954 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
POLR2IP36954 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.6 ms