Protein–RNA interactions for Protein: P35222

CTNNB1, Catenin beta-1, humanhuman

Predictions only

Length 781 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTNNB1P35222 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CTNNB1P35222 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CTNNB1P35222 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CTNNB1P35222 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CTNNB1P35222 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CTNNB1P35222 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CTNNB1P35222 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CTNNB1P35222 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CTNNB1P35222 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CTNNB1P35222 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CTNNB1P35222 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CTNNB1P35222 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CTNNB1P35222 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CTNNB1P35222 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CTNNB1P35222 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CTNNB1P35222 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CTNNB1P35222 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CTNNB1P35222 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
CTNNB1P35222 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CTNNB1P35222 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
CTNNB1P35222 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CTNNB1P35222 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CTNNB1P35222 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CTNNB1P35222 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CTNNB1P35222 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CTNNB1P35222 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CTNNB1P35222 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
CTNNB1P35222 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CTNNB1P35222 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CTNNB1P35222 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CTNNB1P35222 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CTNNB1P35222 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CTNNB1P35222 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CTNNB1P35222 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CTNNB1P35222 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CTNNB1P35222 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
CTNNB1P35222 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CTNNB1P35222 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
CTNNB1P35222 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CTNNB1P35222 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CTNNB1P35222 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CTNNB1P35222 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CTNNB1P35222 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CTNNB1P35222 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CTNNB1P35222 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
CTNNB1P35222 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CTNNB1P35222 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CTNNB1P35222 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CTNNB1P35222 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CTNNB1P35222 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CTNNB1P35222 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CTNNB1P35222 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CTNNB1P35222 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CTNNB1P35222 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
CTNNB1P35222 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CTNNB1P35222 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CTNNB1P35222 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CTNNB1P35222 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CTNNB1P35222 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CTNNB1P35222 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CTNNB1P35222 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CTNNB1P35222 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CTNNB1P35222 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CTNNB1P35222 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CTNNB1P35222 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CTNNB1P35222 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
CTNNB1P35222 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CTNNB1P35222 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CTNNB1P35222 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CTNNB1P35222 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CTNNB1P35222 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CTNNB1P35222 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CTNNB1P35222 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CTNNB1P35222 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
CTNNB1P35222 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
CTNNB1P35222 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CTNNB1P35222 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
CTNNB1P35222 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CTNNB1P35222 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
CTNNB1P35222 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
CTNNB1P35222 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
CTNNB1P35222 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CTNNB1P35222 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC24.45■■□□□ 1.5
CTNNB1P35222 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
CTNNB1P35222 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CTNNB1P35222 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CTNNB1P35222 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CTNNB1P35222 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CTNNB1P35222 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CTNNB1P35222 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CTNNB1P35222 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
CTNNB1P35222 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
CTNNB1P35222 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CTNNB1P35222 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CTNNB1P35222 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CTNNB1P35222 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CTNNB1P35222 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CTNNB1P35222 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CTNNB1P35222 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CTNNB1P35222 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.1 ms