Protein–RNA interactions for Protein: P34741

SDC2, Syndecan-2, humanhuman

Predictions only

Length 201 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SDC2P34741 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
SDC2P34741 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
SDC2P34741 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
SDC2P34741 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
SDC2P34741 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
SDC2P34741 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
SDC2P34741 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
SDC2P34741 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
SDC2P34741 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
SDC2P34741 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
SDC2P34741 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
SDC2P34741 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
SDC2P34741 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
SDC2P34741 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
SDC2P34741 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC20.25■□□□□ 0.83
SDC2P34741 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
SDC2P34741 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
SDC2P34741 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC20.25■□□□□ 0.83
SDC2P34741 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
SDC2P34741 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
SDC2P34741 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
SDC2P34741 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
SDC2P34741 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SDC2P34741 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SDC2P34741 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SDC2P34741 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SDC2P34741 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
SDC2P34741 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
SDC2P34741 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SDC2P34741 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SDC2P34741 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
SDC2P34741 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SDC2P34741 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
SDC2P34741 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
SDC2P34741 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
SDC2P34741 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
SDC2P34741 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
SDC2P34741 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
SDC2P34741 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
SDC2P34741 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
SDC2P34741 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
SDC2P34741 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
SDC2P34741 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
SDC2P34741 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SDC2P34741 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SDC2P34741 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SDC2P34741 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
SDC2P34741 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SDC2P34741 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
SDC2P34741 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
SDC2P34741 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
SDC2P34741 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
SDC2P34741 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
SDC2P34741 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
SDC2P34741 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SDC2P34741 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
SDC2P34741 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
SDC2P34741 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SDC2P34741 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
SDC2P34741 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SDC2P34741 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SDC2P34741 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SDC2P34741 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
SDC2P34741 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
SDC2P34741 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SDC2P34741 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
SDC2P34741 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.83
SDC2P34741 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SDC2P34741 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SDC2P34741 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SDC2P34741 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
SDC2P34741 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SDC2P34741 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SDC2P34741 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SDC2P34741 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SDC2P34741 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SDC2P34741 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SDC2P34741 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
SDC2P34741 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SDC2P34741 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SDC2P34741 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SDC2P34741 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SDC2P34741 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SDC2P34741 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SDC2P34741 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SDC2P34741 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SDC2P34741 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SDC2P34741 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SDC2P34741 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SDC2P34741 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SDC2P34741 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SDC2P34741 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SDC2P34741 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SDC2P34741 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SDC2P34741 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SDC2P34741 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SDC2P34741 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SDC2P34741 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SDC2P34741 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SDC2P34741 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.4 ms