Protein–RNA interactions for Protein: P26951

IL3RA, Interleukin-3 receptor subunit alpha, humanhuman

Predictions only

Length 378 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IL3RAP26951 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
IL3RAP26951 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
IL3RAP26951 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
IL3RAP26951 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
IL3RAP26951 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
IL3RAP26951 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
IL3RAP26951 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
IL3RAP26951 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
IL3RAP26951 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
IL3RAP26951 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
IL3RAP26951 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
IL3RAP26951 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
IL3RAP26951 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
IL3RAP26951 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
IL3RAP26951 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
IL3RAP26951 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.61
IL3RAP26951 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.61
IL3RAP26951 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
IL3RAP26951 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
IL3RAP26951 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC18.83■□□□□ 0.6
IL3RAP26951 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
IL3RAP26951 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
IL3RAP26951 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
IL3RAP26951 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
IL3RAP26951 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
IL3RAP26951 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
IL3RAP26951 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC18.82■□□□□ 0.6
IL3RAP26951 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
IL3RAP26951 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
IL3RAP26951 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
IL3RAP26951 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
IL3RAP26951 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
IL3RAP26951 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
IL3RAP26951 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
IL3RAP26951 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
IL3RAP26951 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
IL3RAP26951 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
IL3RAP26951 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
IL3RAP26951 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
IL3RAP26951 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
IL3RAP26951 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
IL3RAP26951 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC18.81■□□□□ 0.6
IL3RAP26951 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
IL3RAP26951 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
IL3RAP26951 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
IL3RAP26951 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
IL3RAP26951 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
IL3RAP26951 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
IL3RAP26951 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
IL3RAP26951 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
IL3RAP26951 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
IL3RAP26951 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
IL3RAP26951 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
IL3RAP26951 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
IL3RAP26951 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
IL3RAP26951 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
IL3RAP26951 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
IL3RAP26951 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
IL3RAP26951 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
IL3RAP26951 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
IL3RAP26951 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
IL3RAP26951 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
IL3RAP26951 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
IL3RAP26951 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
IL3RAP26951 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
IL3RAP26951 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
IL3RAP26951 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
IL3RAP26951 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
IL3RAP26951 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
IL3RAP26951 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
IL3RAP26951 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
IL3RAP26951 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
IL3RAP26951 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
IL3RAP26951 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
IL3RAP26951 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
IL3RAP26951 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
IL3RAP26951 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
IL3RAP26951 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
IL3RAP26951 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
IL3RAP26951 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
IL3RAP26951 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
IL3RAP26951 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
IL3RAP26951 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
IL3RAP26951 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
IL3RAP26951 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
IL3RAP26951 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
IL3RAP26951 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
IL3RAP26951 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC18.77■□□□□ 0.59
IL3RAP26951 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.59
IL3RAP26951 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
IL3RAP26951 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
IL3RAP26951 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
IL3RAP26951 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
IL3RAP26951 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
IL3RAP26951 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
IL3RAP26951 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
IL3RAP26951 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
IL3RAP26951 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
IL3RAP26951 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
IL3RAP26951 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.8 ms