Protein–RNA interactions for Protein: P23760

PAX3, Paired box protein Pax-3, humanhuman

Predictions only

Length 479 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PAX3P23760 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
PAX3P23760 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PAX3P23760 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PAX3P23760 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PAX3P23760 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PAX3P23760 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PAX3P23760 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
PAX3P23760 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PAX3P23760 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PAX3P23760 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PAX3P23760 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PAX3P23760 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
PAX3P23760 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PAX3P23760 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
PAX3P23760 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
PAX3P23760 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PAX3P23760 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
PAX3P23760 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
PAX3P23760 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
PAX3P23760 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
PAX3P23760 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
PAX3P23760 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PAX3P23760 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PAX3P23760 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PAX3P23760 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
PAX3P23760 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
PAX3P23760 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
PAX3P23760 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
PAX3P23760 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
PAX3P23760 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
PAX3P23760 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
PAX3P23760 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
PAX3P23760 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
PAX3P23760 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
PAX3P23760 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
PAX3P23760 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PAX3P23760 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
PAX3P23760 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
PAX3P23760 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
PAX3P23760 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
PAX3P23760 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PAX3P23760 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
PAX3P23760 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PAX3P23760 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
PAX3P23760 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
PAX3P23760 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
PAX3P23760 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
PAX3P23760 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
PAX3P23760 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
PAX3P23760 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
PAX3P23760 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
PAX3P23760 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
PAX3P23760 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PAX3P23760 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
PAX3P23760 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
PAX3P23760 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PAX3P23760 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
PAX3P23760 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PAX3P23760 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
PAX3P23760 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PAX3P23760 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PAX3P23760 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
PAX3P23760 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PAX3P23760 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
PAX3P23760 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC24.37■■□□□ 1.49
PAX3P23760 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
PAX3P23760 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PAX3P23760 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
PAX3P23760 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
PAX3P23760 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
PAX3P23760 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
PAX3P23760 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
PAX3P23760 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
PAX3P23760 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
PAX3P23760 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC24.35■■□□□ 1.49
PAX3P23760 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PAX3P23760 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
PAX3P23760 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PAX3P23760 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PAX3P23760 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PAX3P23760 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
PAX3P23760 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PAX3P23760 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
PAX3P23760 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
PAX3P23760 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
PAX3P23760 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
PAX3P23760 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
PAX3P23760 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
PAX3P23760 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
PAX3P23760 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
PAX3P23760 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
PAX3P23760 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
PAX3P23760 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
PAX3P23760 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
PAX3P23760 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.48
PAX3P23760 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
PAX3P23760 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
PAX3P23760 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PAX3P23760 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
PAX3P23760 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.3 ms