Protein–RNA interactions for Protein: P23109

AMPD1, AMP deaminase 1, humanhuman

Predictions only

Length 780 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AMPD1P23109 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
AMPD1P23109 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
AMPD1P23109 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
AMPD1P23109 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
AMPD1P23109 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
AMPD1P23109 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
AMPD1P23109 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
AMPD1P23109 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
AMPD1P23109 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
AMPD1P23109 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
AMPD1P23109 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
AMPD1P23109 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
AMPD1P23109 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
AMPD1P23109 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
AMPD1P23109 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
AMPD1P23109 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
AMPD1P23109 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
AMPD1P23109 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
AMPD1P23109 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
AMPD1P23109 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
AMPD1P23109 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
AMPD1P23109 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
AMPD1P23109 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
AMPD1P23109 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
AMPD1P23109 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
AMPD1P23109 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
AMPD1P23109 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
AMPD1P23109 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
AMPD1P23109 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
AMPD1P23109 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
AMPD1P23109 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
AMPD1P23109 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
AMPD1P23109 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
AMPD1P23109 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
AMPD1P23109 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
AMPD1P23109 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
AMPD1P23109 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
AMPD1P23109 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
AMPD1P23109 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
AMPD1P23109 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
AMPD1P23109 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
AMPD1P23109 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
AMPD1P23109 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
AMPD1P23109 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
AMPD1P23109 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
AMPD1P23109 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
AMPD1P23109 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
AMPD1P23109 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
AMPD1P23109 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
AMPD1P23109 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
AMPD1P23109 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
AMPD1P23109 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
AMPD1P23109 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
AMPD1P23109 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC23.63■■□□□ 1.37
AMPD1P23109 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
AMPD1P23109 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
AMPD1P23109 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
AMPD1P23109 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
AMPD1P23109 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
AMPD1P23109 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
AMPD1P23109 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
AMPD1P23109 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
AMPD1P23109 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
AMPD1P23109 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
AMPD1P23109 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
AMPD1P23109 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
AMPD1P23109 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
AMPD1P23109 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
AMPD1P23109 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
AMPD1P23109 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
AMPD1P23109 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
AMPD1P23109 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
AMPD1P23109 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
AMPD1P23109 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
AMPD1P23109 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
AMPD1P23109 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
AMPD1P23109 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
AMPD1P23109 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
AMPD1P23109 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
AMPD1P23109 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
AMPD1P23109 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
AMPD1P23109 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
AMPD1P23109 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
AMPD1P23109 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
AMPD1P23109 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
AMPD1P23109 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
AMPD1P23109 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
AMPD1P23109 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
AMPD1P23109 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
AMPD1P23109 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
AMPD1P23109 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
AMPD1P23109 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
AMPD1P23109 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
AMPD1P23109 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
AMPD1P23109 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
AMPD1P23109 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
AMPD1P23109 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
AMPD1P23109 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
AMPD1P23109 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
AMPD1P23109 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.1 ms