Protein–RNA interactions for Protein: P21579

SYT1, Synaptotagmin-1, humanhuman

Predictions only

Length 422 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYT1P21579 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
SYT1P21579 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
SYT1P21579 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
SYT1P21579 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
SYT1P21579 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
SYT1P21579 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC26.66■■□□□ 1.86
SYT1P21579 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
SYT1P21579 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
SYT1P21579 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
SYT1P21579 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
SYT1P21579 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
SYT1P21579 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC26.65■■□□□ 1.86
SYT1P21579 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC26.65■■□□□ 1.86
SYT1P21579 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC26.65■■□□□ 1.86
SYT1P21579 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
SYT1P21579 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
SYT1P21579 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
SYT1P21579 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
SYT1P21579 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.86
SYT1P21579 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
SYT1P21579 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC26.64■■□□□ 1.86
SYT1P21579 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.86
SYT1P21579 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
SYT1P21579 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
SYT1P21579 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.86
SYT1P21579 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
SYT1P21579 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
SYT1P21579 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.85
SYT1P21579 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
SYT1P21579 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
SYT1P21579 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
SYT1P21579 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
SYT1P21579 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
SYT1P21579 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
SYT1P21579 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
SYT1P21579 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
SYT1P21579 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
SYT1P21579 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
SYT1P21579 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC26.62■■□□□ 1.85
SYT1P21579 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
SYT1P21579 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
SYT1P21579 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC26.62■■□□□ 1.85
SYT1P21579 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
SYT1P21579 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
SYT1P21579 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
SYT1P21579 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
SYT1P21579 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
SYT1P21579 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
SYT1P21579 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
SYT1P21579 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
SYT1P21579 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
SYT1P21579 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
SYT1P21579 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
SYT1P21579 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
SYT1P21579 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC26.59■■□□□ 1.85
SYT1P21579 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC26.59■■□□□ 1.85
SYT1P21579 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC26.59■■□□□ 1.85
SYT1P21579 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
SYT1P21579 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC26.59■■□□□ 1.85
SYT1P21579 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC26.58■■□□□ 1.85
SYT1P21579 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
SYT1P21579 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
SYT1P21579 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
SYT1P21579 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.84
SYT1P21579 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC26.57■■□□□ 1.84
SYT1P21579 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
SYT1P21579 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
SYT1P21579 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
SYT1P21579 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
SYT1P21579 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
SYT1P21579 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
SYT1P21579 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
SYT1P21579 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
SYT1P21579 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC26.56■■□□□ 1.84
SYT1P21579 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
SYT1P21579 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
SYT1P21579 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
SYT1P21579 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
SYT1P21579 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
SYT1P21579 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
SYT1P21579 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
SYT1P21579 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
SYT1P21579 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
SYT1P21579 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
SYT1P21579 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
SYT1P21579 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
SYT1P21579 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
SYT1P21579 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
SYT1P21579 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
SYT1P21579 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
SYT1P21579 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.54■■□□□ 1.84
SYT1P21579 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
SYT1P21579 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
SYT1P21579 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
SYT1P21579 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
SYT1P21579 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
SYT1P21579 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
SYT1P21579 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
SYT1P21579 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
SYT1P21579 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.7 ms